42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3088 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3088  DnaD domain-containing protein  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3331  DnaD domain-containing protein  100 
 
 
246 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3032  hypothetical protein  92.68 
 
 
243 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2981  hypothetical protein  93.09 
 
 
246 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3294  DnaD domain-containing protein  90.09 
 
 
250 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3302  DnaD domain protein  87.93 
 
 
250 aa  417  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3310  DnaD domain protein  92.67 
 
 
247 aa  417  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2999  primosome, DnaD subunit  84.52 
 
 
252 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000267643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3267  DnaD domain protein  84.17 
 
 
254 aa  395  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1980  phage protein  81.33 
 
 
258 aa  387  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0831  primosome, DnaD subunit  66.24 
 
 
286 aa  315  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  66.09 
 
 
286 aa  314  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  64.1 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  64.1 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  64.96 
 
 
286 aa  312  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  64.78 
 
 
286 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  65.22 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  64.78 
 
 
286 aa  310  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  65.09 
 
 
288 aa  308  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  45.38 
 
 
316 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  45.42 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  36.84 
 
 
309 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  35.63 
 
 
311 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  35.34 
 
 
313 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2214  DnaA analog, DnaD domain protein  39.68 
 
 
296 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  37.8 
 
 
282 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  48.04 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0808  hypothetical protein  40.23 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  27.21 
 
 
430 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2293  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.104847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2153  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.458143  normal  0.0691122 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_480  primosome component  36.36 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0515  primosome, DnaD subunit  32.32 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0539  DnaD and phage-associated domain-containing protein  36.36 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1148  primosome, DnaD subunit  32.84 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000149796  decreased coverage  0.00111014 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0424  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  33.87 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3989  primosome, DnaD subunit  31.34 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2597  phage replication protein  32.81 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0438  prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  33.87 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000555393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0088  primosome, DnaD subunit  30.38 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  31.25 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  32.94 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>