More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2488 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2488  GntR family transcriptional regulator N-terminal  100 
 
 
110 aa  226  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0979102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  98.18 
 
 
477 aa  223  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  96.36 
 
 
477 aa  221  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  97.27 
 
 
477 aa  221  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  97.27 
 
 
478 aa  219  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  95.45 
 
 
485 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  94.55 
 
 
477 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  90.91 
 
 
503 aa  213  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  94.68 
 
 
461 aa  184  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  53.27 
 
 
480 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
476 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  52.43 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  52.43 
 
 
480 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  52.43 
 
 
480 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 
481 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
480 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  38.32 
 
 
483 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
477 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
480 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  40.2 
 
 
477 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
477 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.42 
 
 
477 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.42 
 
 
477 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  39.42 
 
 
477 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
477 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  40.2 
 
 
477 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.42 
 
 
477 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  38.32 
 
 
480 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
477 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
233 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  40 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  42.67 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
547 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  34.69 
 
 
232 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
251 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  43.08 
 
 
233 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
235 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  42.03 
 
 
234 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.81 
 
 
491 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
501 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 
242 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 
554 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  43.08 
 
 
234 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
321 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
256 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
243 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  34.62 
 
 
240 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
248 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 
520 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  41.54 
 
 
235 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6110  histidine utilization repressor  40.54 
 
 
251 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
243 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  42.42 
 
 
231 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
520 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  40.54 
 
 
251 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6592  histidine utilization repressor  40.54 
 
 
251 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  0.101362 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  41.79 
 
 
231 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
232 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
266 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
266 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
266 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
266 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
266 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
246 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0743  GntR domain-containing protein  40 
 
 
286 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
332 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
376 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  36.71 
 
 
478 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
243 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
235 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
308 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  34.83 
 
 
520 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  42.42 
 
 
231 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 
242 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  42.42 
 
 
231 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  42.86 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  42.42 
 
 
231 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  39.13 
 
 
235 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
246 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
243 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
243 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  42.42 
 
 
231 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>