More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS1452 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  96.68 
 
 
934 aa  1836  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  99.36 
 
 
934 aa  1921  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  45.18 
 
 
921 aa  788  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  95.43 
 
 
934 aa  1828  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
934 aa  1929  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  79.66 
 
 
929 aa  1560  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  92.17 
 
 
934 aa  1783  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  97.16 
 
 
934 aa  1843  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  6.49538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
934 aa  1929  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  91.95 
 
 
934 aa  1779  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  43.41 
 
 
909 aa  753  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  99.25 
 
 
934 aa  1918  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  99.25 
 
 
934 aa  1918  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.72 
 
 
930 aa  479  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.08 
 
 
921 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.84 
 
 
921 aa  471  1e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.06 
 
 
956 aa  459  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.77 
 
 
944 aa  454  1e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  32.41 
 
 
929 aa  447  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.39 
 
 
952 aa  442  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.39 
 
 
934 aa  439  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.4 
 
 
927 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  32.15 
 
 
954 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.44 
 
 
957 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.48 
 
 
960 aa  416  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.77 
 
 
897 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.77 
 
 
897 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  29.57 
 
 
902 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.73 
 
 
851 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.66591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  31.53 
 
 
832 aa  341  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  31.67 
 
 
822 aa  340  1e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.36 
 
 
876 aa  328  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  29.65 
 
 
838 aa  327  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  28.72 
 
 
843 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.77416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  30.01 
 
 
843 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  28.8 
 
 
830 aa  315  4e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  29.67 
 
 
830 aa  312  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  32.1 
 
 
640 aa  312  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  28.29 
 
 
840 aa  312  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.74 
 
 
966 aa  310  9e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  1.16759e-05  hitchhiker  6.48685e-10 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.15 
 
 
978 aa  308  4e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.92 
 
 
661 aa  306  9e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  9.73223e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.58 
 
 
729 aa  304  5e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  30.5 
 
 
659 aa  302  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.26 
 
 
646 aa  301  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  30.47 
 
 
647 aa  300  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  29.59 
 
 
709 aa  297  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  26.13 
 
 
986 aa  291  5e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  30.68 
 
 
646 aa  290  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  29.38 
 
 
646 aa  289  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.3 
 
 
647 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  29.9 
 
 
650 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.87 
 
 
639 aa  285  3e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  30.14 
 
 
635 aa  284  4e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  30.21 
 
 
707 aa  283  7e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  28.78 
 
 
646 aa  283  8e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  30.16 
 
 
639 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.86 
 
 
640 aa  279  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  28.65 
 
 
698 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  31.16 
 
 
636 aa  278  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  29.07 
 
 
633 aa  278  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  28.59 
 
 
651 aa  276  1e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  30.37 
 
 
667 aa  276  1e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  29.07 
 
 
631 aa  276  2e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  29.7 
 
 
649 aa  276  2e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.67 
 
 
652 aa  276  2e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  28.89 
 
 
644 aa  275  2e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.87 
 
 
652 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  29.66 
 
 
658 aa  273  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  27.42 
 
 
846 aa  272  3e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.34 
 
 
662 aa  272  3e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  29.54 
 
 
633 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  29.65 
 
 
725 aa  271  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  29.91 
 
 
653 aa  270  9e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  29.37 
 
 
659 aa  270  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  29.39 
 
 
643 aa  269  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  29.78 
 
 
659 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  28.99 
 
 
725 aa  268  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  29.4 
 
 
713 aa  268  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  29.49 
 
 
674 aa  266  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  29.39 
 
 
639 aa  266  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  29.91 
 
 
674 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  29.53 
 
 
636 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  28.49 
 
 
664 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  29.53 
 
 
636 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  29.53 
 
 
636 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.96 
 
 
641 aa  263  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  29.99 
 
 
636 aa  262  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  29.53 
 
 
636 aa  262  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  29.53 
 
 
636 aa  262  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  28.99 
 
 
651 aa  262  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  29.99 
 
 
636 aa  262  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  28.82 
 
 
669 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  29.84 
 
 
636 aa  259  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>