More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0292 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  52.6 
 
 
672 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  48.74 
 
 
670 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  52.34 
 
 
680 aa  696    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  62.08 
 
 
665 aa  848    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  98.65 
 
 
669 aa  1353    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.46 
 
 
652 aa  639    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 
663 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  54.03 
 
 
662 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 
669 aa  1370    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  99.55 
 
 
669 aa  1365    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  99.4 
 
 
669 aa  1363    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  98.95 
 
 
669 aa  1358    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  54.89 
 
 
670 aa  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  52.81 
 
 
670 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  54.35 
 
 
672 aa  718    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  71.9 
 
 
670 aa  991    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  98.06 
 
 
669 aa  1348    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  49.18 
 
 
671 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 
669 aa  1370    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  53.29 
 
 
663 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  54.92 
 
 
659 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  52.98 
 
 
666 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  60.51 
 
 
667 aa  832    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  91.78 
 
 
669 aa  1275    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  98.51 
 
 
669 aa  1354    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  54.17 
 
 
677 aa  702    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  51.21 
 
 
673 aa  697    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  60.51 
 
 
667 aa  832    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  67.86 
 
 
670 aa  927    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  99.85 
 
 
669 aa  1370    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  56.61 
 
 
684 aa  771    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  98.51 
 
 
669 aa  1350    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  50.3 
 
 
661 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  50 
 
 
686 aa  665    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  50.45 
 
 
668 aa  667    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  50.97 
 
 
680 aa  660    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.21 
 
 
648 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  46.82 
 
 
662 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  47.28 
 
 
688 aa  634  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  47.28 
 
 
688 aa  634  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  48.19 
 
 
684 aa  626  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  48.43 
 
 
683 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.71 
 
 
670 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  48.66 
 
 
671 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  47.53 
 
 
690 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.56 
 
 
670 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.23 
 
 
673 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.56 
 
 
670 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.62 
 
 
671 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 
671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  46.94 
 
 
671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.49 
 
 
670 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 
671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 
671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.8 
 
 
671 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  46.94 
 
 
671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 
671 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  47.25 
 
 
683 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  48.29 
 
 
668 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.97 
 
 
697 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  46.42 
 
 
711 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.65 
 
 
671 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  45 
 
 
668 aa  609  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  47.95 
 
 
673 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl160  DNA ligase, polydeoxyribonucleotide synthase NAD+  48.65 
 
 
666 aa  606  9.999999999999999e-173  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0025564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.05 
 
 
671 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.93 
 
 
679 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0712  DNA ligase, NAD-dependent  46.64 
 
 
668 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  48.44 
 
 
668 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  48.2 
 
 
675 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.05 
 
 
671 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.85 
 
 
694 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  47.7 
 
 
672 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  46.63 
 
 
691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  46.63 
 
 
691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 
678 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  46.63 
 
 
691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.54 
 
 
669 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  46.63 
 
 
691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.92 
 
 
681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  45.77 
 
 
691 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  46.67 
 
 
673 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  46.48 
 
 
691 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  46.48 
 
 
691 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  46.08 
 
 
674 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  45.88 
 
 
691 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  47.49 
 
 
671 aa  598  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  45.93 
 
 
674 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  46.48 
 
 
691 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  48.95 
 
 
678 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.1 
 
 
669 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  47.08 
 
 
674 aa  596  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.36 
 
 
681 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.49 
 
 
690 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  46.06 
 
 
691 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  45.91 
 
 
691 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  46.21 
 
 
691 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>