More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1267 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  100 
 
 
147 aa  303  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  64.03 
 
 
145 aa  193  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  65.19 
 
 
147 aa  192  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  65.19 
 
 
147 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  64.44 
 
 
136 aa  189  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  62.69 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  59.57 
 
 
138 aa  179  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 
139 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  62.12 
 
 
139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  58.65 
 
 
164 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
164 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  57.14 
 
 
166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  55.64 
 
 
171 aa  160  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  53.79 
 
 
158 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  57.5 
 
 
208 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  56.39 
 
 
166 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  56.39 
 
 
166 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  54.2 
 
 
143 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  52.9 
 
 
137 aa  140  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  48.87 
 
 
165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  48.87 
 
 
168 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  48.87 
 
 
165 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  49.62 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  48.87 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  48.87 
 
 
162 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  49.29 
 
 
149 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  48.87 
 
 
152 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  44.93 
 
 
143 aa  124  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  46.88 
 
 
164 aa  123  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  48.44 
 
 
147 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  57 
 
 
158 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  45.71 
 
 
138 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  42.55 
 
 
174 aa  113  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  44.62 
 
 
146 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
164 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  41.43 
 
 
146 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  41.43 
 
 
146 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  47.83 
 
 
161 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  38.85 
 
 
158 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  37.5 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  38.46 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  32.81 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  29.9 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  39.51 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  32.48 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  36.54 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.24 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.24 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  30.1 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  33.71 
 
 
169 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.24 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.24 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.24 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.24 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.24 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  37 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  33.04 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  38.27 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  36.54 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  36.36 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  32.23 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  30.43 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  35.8 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  35.23 
 
 
149 aa  59.3  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  32.77 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  35.23 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  37.65 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  34.57 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  35.05 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  37.65 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>