103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1214 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  100 
 
 
300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  37.27 
 
 
284 aa  201  9e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  38.41 
 
 
281 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  38.74 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  38.74 
 
 
228 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  35.31 
 
 
228 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  37.42 
 
 
229 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  37.25 
 
 
236 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  33.88 
 
 
230 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  33.88 
 
 
230 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  34.21 
 
 
229 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  32.04 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  31.27 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  31.27 
 
 
240 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  27.34 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.38 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  27.42 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  25.83 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  25.56 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  26.01 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.05 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  25.8 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  25.94 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  24.17 
 
 
213 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  26.22 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  24.36 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  22.73 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  26.28 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  27.35 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  23.67 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  26.78 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  23.84 
 
 
206 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  26.24 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  29.15 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  24.67 
 
 
205 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  25.09 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  24.31 
 
 
207 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  24.3 
 
 
207 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  26.45 
 
 
193 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  23.48 
 
 
693 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  25.17 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  25.67 
 
 
447 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  25.17 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  24.91 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  25.27 
 
 
570 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  23.86 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  23.42 
 
 
250 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  25.67 
 
 
215 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  26.8 
 
 
274 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  24.34 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  23.67 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  23.19 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2970  hypothetical protein  24.22 
 
 
276 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  24.13 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  44.26 
 
 
212 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4835  porin  23.77 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  25.42 
 
 
708 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  25.34 
 
 
452 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  24 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  21.98 
 
 
207 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1117  hypothetical protein  23.9 
 
 
274 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  21.29 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  24.33 
 
 
207 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  21.93 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  22.85 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  26 
 
 
242 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  25.71 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3063  porin  25 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  25.71 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  24.1 
 
 
661 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  24.57 
 
 
638 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  38.71 
 
 
212 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  21.29 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  28.5 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4552  porin  24.71 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.477499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  35.14 
 
 
212 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  23.26 
 
 
665 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  26.83 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1819  hypothetical protein  23.91 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  25.63 
 
 
692 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  25.16 
 
 
449 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  21.48 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  20.86 
 
 
652 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  23.34 
 
 
645 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  25.36 
 
 
566 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  39.29 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  31.19 
 
 
209 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3911  hypothetical protein  23.99 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  24.04 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  24.83 
 
 
449 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  24.91 
 
 
583 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  23.47 
 
 
240 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1310  hypothetical protein  22.37 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  27.49 
 
 
703 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  25.52 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  25.52 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  27.49 
 
 
703 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  23.81 
 
 
570 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3415  putative outer membrane protein of unknown function  22.19 
 
 
680 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154801  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  23.88 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>