227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1076 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  100 
 
 		 250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  44.76 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  44.12 
 
 		 385 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  40.68 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  36.65 
 
 		 370 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  36.69 
 
 		 370 aa  154  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  35.74 
 
 		 389 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  35.48 
 
 		 405 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  33.85 
 
 		 367 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  64.89 
 
 		 95 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  35.34 
 
 		 426 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  32.91 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  27.8 
 
 		 382 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0771  hypothetical protein  56.38 
 
 		 90 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.800148  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 375 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  32.28 
 
 		 359 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  31.5 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  31.89 
 
 		 362 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  32.52 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 389 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  27.71 
 
 		 341 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  26.69 
 
 		 343 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 335 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 357 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  27.43 
 
 		 341 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  27.73 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  24.44 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  27.31 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  24.52 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  20.78 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  23.53 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  23.98 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 413 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  23.79 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.51 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  24.68 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  24.47 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  23.94 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  25.1 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  23.29 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0221  integrase domain protein SAM domain protein  28.31 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.72 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  23.47 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.07 
 
 		 413 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  19.91 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  22.13 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.26 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.11 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  25 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  25.64 
 
 		 164 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  23.39 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  23.68 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  21.4 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  23.28 
 
 		 421 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1588  putative phage integrase/recombinase  46.67 
 
 		 66 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.497488  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  29.31 
 
 		 125 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.59 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.89 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  24.8 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  23.63 
 
 		 329 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.83 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  24.14 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  24.29 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.29 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.1 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  25.57 
 
 		 373 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  23.41 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  22.78 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  21.26 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  20.27 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  22.42 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  21.86 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.05 
 
 		 378 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  19.92 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.48 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  24.64 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  28.06 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.28 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.21 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  23.04 
 
 		 334 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.42 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  26.94 
 
 		 338 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>