169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0848 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  36.02 
 
 
221 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  35.85 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  37.12 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  40 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  40 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  35.06 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  38.85 
 
 
161 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  38.62 
 
 
192 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.69 
 
 
226 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  38.46 
 
 
214 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.56 
 
 
214 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  40.29 
 
 
227 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  39.57 
 
 
227 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  38.85 
 
 
227 aa  99  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  35.86 
 
 
534 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.27 
 
 
212 aa  98.2  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  34.38 
 
 
163 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  34.51 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  34.27 
 
 
211 aa  92  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  28.75 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  39.33 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  36 
 
 
185 aa  87.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  34.23 
 
 
358 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  31.82 
 
 
241 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.07 
 
 
172 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  34.56 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  32.58 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  30.94 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  32.59 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  38.35 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  33.33 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.07 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.82 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  29.01 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.14 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.72 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  32.82 
 
 
249 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  32.08 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.39 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.67 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  35.43 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.22 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.11 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  28.29 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  28.29 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  32.08 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.92 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.98 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.56 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.5 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.69 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  30.43 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  27.67 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  31.3 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.1 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.36 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  28.4 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  25.56 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.58 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.17 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  30.83 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.74 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  29.21 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  30.5 
 
 
231 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.68 
 
 
153 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  30.71 
 
 
272 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  27.34 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  28.87 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  23.6 
 
 
246 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  24.14 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.22 
 
 
192 aa  55.1  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  33.57 
 
 
237 aa  55.1  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  29.14 
 
 
244 aa  54.7  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.91 
 
 
227 aa  54.7  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  28.83 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  30.08 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  27.49 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.86 
 
 
271 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  23.23 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  27.54 
 
 
280 aa  52.4  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  26.04 
 
 
157 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.07 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  31.21 
 
 
227 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  29.23 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  32.41 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  32.69 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  28.36 
 
 
247 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  27.68 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>