More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0667 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  76.21 
 
 
206 aa  324  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  75.73 
 
 
206 aa  322  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  75.73 
 
 
206 aa  322  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  72.33 
 
 
206 aa  313  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  72.82 
 
 
206 aa  310  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  72.33 
 
 
206 aa  310  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  72.82 
 
 
206 aa  307  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  69.9 
 
 
206 aa  301  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  66.02 
 
 
206 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  66.5 
 
 
206 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  65.53 
 
 
206 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  64.08 
 
 
206 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  64.08 
 
 
206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  64.08 
 
 
206 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 
206 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 
206 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 
206 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  60.68 
 
 
206 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 
206 aa  264  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  63.11 
 
 
206 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  63.11 
 
 
206 aa  263  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 
206 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  58.25 
 
 
206 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  58.25 
 
 
206 aa  247  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 
212 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  57.28 
 
 
211 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  59.71 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  56.8 
 
 
206 aa  221  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  51.94 
 
 
206 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 
206 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  52.76 
 
 
206 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 
205 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  52.26 
 
 
206 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  52.26 
 
 
206 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  48.29 
 
 
204 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1352  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 
208 aa  189  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  48.78 
 
 
208 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 
207 aa  177  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 
216 aa  175  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  43.59 
 
 
207 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  43.28 
 
 
224 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  42.78 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 
207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 
207 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  43.37 
 
 
206 aa  161  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 
207 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  41.79 
 
 
207 aa  158  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 
204 aa  157  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 
205 aa  154  7e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  40.31 
 
 
206 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  37.69 
 
 
207 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
205 aa  149  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  37.44 
 
 
207 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  39.29 
 
 
206 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  38.27 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  38.78 
 
 
207 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  38.95 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  38.07 
 
 
209 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.91 
 
 
206 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  39.2 
 
 
207 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  37.95 
 
 
207 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  37.11 
 
 
205 aa  142  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  37.81 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  38.24 
 
 
207 aa  138  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  36.82 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  37.75 
 
 
223 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  37.19 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  36.6 
 
 
208 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  32.99 
 
 
207 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  34.83 
 
 
206 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  36.41 
 
 
222 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  37.19 
 
 
207 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0267  ribosomal protein L4  42.54 
 
 
214 aa  136  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000335514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  36.89 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  39.06 
 
 
200 aa  135  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  38.19 
 
 
208 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  36.6 
 
 
207 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  36.73 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  37.76 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  35.03 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  37.24 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  36 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  34.85 
 
 
207 aa  134  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  36.95 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  42.61 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  39.39 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>