More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0550 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  100 
 
 		 92 aa  180  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  66.67 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  65.56 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 91 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  63.33 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  65.56 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  65.56 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1701  HU-like DNA-binding protein alpha subunit  66.67 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  63.33 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  63.33 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0493  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.107938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  63.33 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0491  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0126716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0554  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00736621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0510  transcriptional regulator HU subunit beta  64.44 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  63.33 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  63.33 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  63.33 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  61.11 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2492  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00401844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  59.34 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  59.34 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  61.11 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2593  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2678  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3110  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000105676  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2505  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791734  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  54.95 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  56.04 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  56.67 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  61.54 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  57.14 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  56.67 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  57.78 
 
 		 101 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3781  HU family DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0095051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  57.78 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  52.17 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  57.78 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  52.17 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  52.17 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  52.17 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  52.17 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  52.17 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  52.17 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>