More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0489 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  77.49 
 
 
467 aa  713    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  100 
 
 
457 aa  935    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  74.62 
 
 
466 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  71.93 
 
 
466 aa  697    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  77.49 
 
 
467 aa  714    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  74.18 
 
 
466 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  74.24 
 
 
467 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  77.95 
 
 
464 aa  716    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  72.15 
 
 
462 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  69.63 
 
 
499 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  68.6 
 
 
486 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  67.99 
 
 
482 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  68.93 
 
 
503 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  65.86 
 
 
495 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3499  DNA repair protein RadA  64.99 
 
 
485 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  65.28 
 
 
483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  63.83 
 
 
477 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  64.21 
 
 
474 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  66.67 
 
 
477 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  66.28 
 
 
470 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  64.54 
 
 
489 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  63.46 
 
 
476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  63.02 
 
 
481 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  63.68 
 
 
478 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  63.24 
 
 
476 aa  561  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  64.27 
 
 
471 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  58.22 
 
 
455 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  58.68 
 
 
455 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  62.1 
 
 
458 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  56.39 
 
 
453 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  59.02 
 
 
452 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  58.8 
 
 
452 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  58.8 
 
 
452 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  60.19 
 
 
469 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  58.35 
 
 
454 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  60.09 
 
 
460 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  56.89 
 
 
455 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3941  DNA repair protein RadA  62.04 
 
 
454 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  51.73 
 
 
450 aa  463  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  56.48 
 
 
455 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  52.26 
 
 
450 aa  458  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  51.18 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0403  DNA repair protein RadA  53.15 
 
 
466 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1850  DNA repair protein RadA  56.19 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  51.96 
 
 
450 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  51.73 
 
 
452 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  51.39 
 
 
484 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  49.88 
 
 
448 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  47.26 
 
 
454 aa  421  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  49.09 
 
 
457 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  48.52 
 
 
455 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  48.29 
 
 
455 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 
455 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  47.25 
 
 
457 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  51.87 
 
 
448 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  49.54 
 
 
453 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  49.44 
 
 
462 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  50 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  48.86 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  48.12 
 
 
448 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 
450 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50 
 
 
453 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  51.16 
 
 
452 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  51.16 
 
 
452 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 
454 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  48.16 
 
 
454 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  48.39 
 
 
451 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  48.63 
 
 
453 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  48.29 
 
 
477 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 
456 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  48.7 
 
 
447 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  47.79 
 
 
450 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  46.58 
 
 
482 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 
458 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 
449 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 
456 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 
449 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  48.71 
 
 
476 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 
456 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  49.55 
 
 
453 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  48.73 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  48.62 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  48.36 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  47.73 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  47.94 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  48.87 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  48.58 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  48.96 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  47.7 
 
 
453 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  48.73 
 
 
458 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  46.93 
 
 
453 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  45.91 
 
 
482 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 
489 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  47.94 
 
 
463 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  47.39 
 
 
454 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 
470 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  47.94 
 
 
463 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  48.73 
 
 
458 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>