More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0465 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  100 
 
 
158 aa  316  6e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  77.85 
 
 
158 aa  258  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  78.48 
 
 
158 aa  256  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  77.85 
 
 
158 aa  253  8e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  70.75 
 
 
158 aa  221  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  66.89 
 
 
159 aa  217  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  66.23 
 
 
159 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  65.19 
 
 
155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  65.54 
 
 
157 aa  208  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  64.86 
 
 
157 aa  208  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  64.19 
 
 
157 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  64.86 
 
 
157 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  65.31 
 
 
157 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  64.19 
 
 
157 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  64.19 
 
 
157 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  67.81 
 
 
158 aa  201  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  64.15 
 
 
158 aa  201  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  60.76 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  63.01 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  59.73 
 
 
160 aa  194  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  64 
 
 
159 aa  191  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  60.96 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  60.96 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  55.7 
 
 
158 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  56.96 
 
 
158 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  59.59 
 
 
160 aa  184  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  59.86 
 
 
152 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  57.72 
 
 
161 aa  183  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  59.73 
 
 
157 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  62.59 
 
 
157 aa  181  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  57.05 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  58.39 
 
 
157 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  58.6 
 
 
165 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
156 aa  177  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  55.1 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
157 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
157 aa  165  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
157 aa  164  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  53.47 
 
 
148 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  55.4 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  55.4 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  53.55 
 
 
159 aa  160  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  54.48 
 
 
155 aa  160  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  52.82 
 
 
149 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  51.01 
 
 
156 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
161 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
155 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
150 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  46.5 
 
 
162 aa  151  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  48.65 
 
 
155 aa  148  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
149 aa  149  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
155 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.03 
 
 
153 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  51.02 
 
 
160 aa  147  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
159 aa  147  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  49.65 
 
 
159 aa  146  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  48.37 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  51.16 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  51.02 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
150 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
165 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  50 
 
 
165 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  48.1 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  46.58 
 
 
153 aa  144  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
162 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
168 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
168 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  49.32 
 
 
168 aa  144  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
151 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  43.14 
 
 
159 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
160 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  47.8 
 
 
158 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  51.02 
 
 
155 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.63 
 
 
157 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50 
 
 
159 aa  140  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
153 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  50.37 
 
 
149 aa  140  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
148 aa  140  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46.9 
 
 
157 aa  140  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.58 
 
 
159 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  51.45 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  48.28 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  45.95 
 
 
156 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  46.62 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  47.33 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.21 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  50.36 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  46.94 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  45.27 
 
 
158 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
160 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.3 
 
 
154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.62 
 
 
159 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
151 aa  137  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  44.14 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  46.67 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.63 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>