More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0359 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  100 
 
 
359 aa  731    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  78.09 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  76.47 
 
 
359 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  76.47 
 
 
377 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  68.72 
 
 
359 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  69.08 
 
 
359 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  68.99 
 
 
359 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  69.32 
 
 
359 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  68.47 
 
 
360 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  62.75 
 
 
351 aa  454  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  60.73 
 
 
354 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 
350 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  59.77 
 
 
360 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  61.82 
 
 
358 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  59.5 
 
 
355 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 
351 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  60.17 
 
 
351 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  59.6 
 
 
351 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 
351 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 
361 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  57.39 
 
 
358 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  57.34 
 
 
361 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  59.72 
 
 
361 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  57.88 
 
 
361 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  55.99 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
361 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 
359 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  60.55 
 
 
334 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 
359 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
361 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 
360 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  54.85 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  55.65 
 
 
361 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  56 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  57.27 
 
 
361 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 
360 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 
360 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 
360 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  55.71 
 
 
356 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  58.61 
 
 
360 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  57.23 
 
 
360 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  54.67 
 
 
357 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
360 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 
356 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
363 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 
353 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0247  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
359 aa  389  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.736319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  52.1 
 
 
359 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  57.4 
 
 
354 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  53.35 
 
 
354 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  59.52 
 
 
361 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
360 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  56.63 
 
 
360 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  54.65 
 
 
355 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  52.39 
 
 
358 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  55.85 
 
 
367 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 
361 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  58.1 
 
 
361 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 
355 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 
360 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0442  peptide chain release factor 1  54.68 
 
 
359 aa  385  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.34864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 
361 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 
360 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0597  peptide chain release factor 1  52.97 
 
 
359 aa  387  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.349785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  53.22 
 
 
362 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  55 
 
 
357 aa  384  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  53.31 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 
363 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  56.07 
 
 
361 aa  383  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 
360 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  53.04 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  55.83 
 
 
359 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  54.79 
 
 
360 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  51.67 
 
 
362 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  51.67 
 
 
362 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  55.76 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 
355 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 
363 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  56.36 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
360 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 
356 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  55.76 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  55.83 
 
 
359 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  51.51 
 
 
363 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  57.02 
 
 
357 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  54.24 
 
 
363 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  54.55 
 
 
363 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  54.42 
 
 
356 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 
355 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
361 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
354 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>