More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0056 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 
424 aa  874    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  60.81 
 
 
421 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  59.38 
 
 
421 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  60.81 
 
 
421 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  58.06 
 
 
422 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  57.96 
 
 
421 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  56.77 
 
 
421 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  57.01 
 
 
421 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  56.53 
 
 
421 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  55.82 
 
 
421 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  57.35 
 
 
422 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  57.11 
 
 
422 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  56.16 
 
 
430 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  56.06 
 
 
421 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  55.11 
 
 
421 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  55.92 
 
 
422 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  57.01 
 
 
423 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  55.58 
 
 
422 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  57.28 
 
 
423 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  57.72 
 
 
423 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  55.82 
 
 
421 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2123  diaminopimelate decarboxylase  55.82 
 
 
422 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  54.63 
 
 
422 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  53.21 
 
 
422 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4044  diaminopimelate decarboxylase  55.34 
 
 
422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 
420 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  51.07 
 
 
431 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 
421 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  50.83 
 
 
421 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  50.83 
 
 
421 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  51.31 
 
 
421 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  52.61 
 
 
422 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  49.64 
 
 
421 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  51.07 
 
 
425 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  49.41 
 
 
421 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  48.22 
 
 
417 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  50.12 
 
 
414 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0203  diaminopimelate decarboxylase  48.7 
 
 
419 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.628049  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  45.63 
 
 
434 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  45.15 
 
 
417 aa  388  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  48.68 
 
 
414 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  48.66 
 
 
414 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  45.61 
 
 
417 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  48.66 
 
 
414 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  48.8 
 
 
414 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  48.57 
 
 
417 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  47.82 
 
 
419 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  48.44 
 
 
416 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  49.15 
 
 
414 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  49.76 
 
 
418 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  47.93 
 
 
414 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  46.34 
 
 
419 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  46.63 
 
 
423 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  47.93 
 
 
414 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  47.49 
 
 
417 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  47.93 
 
 
414 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  48.4 
 
 
416 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  49.14 
 
 
416 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  49.64 
 
 
415 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  47.97 
 
 
417 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  47.45 
 
 
414 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  43.71 
 
 
417 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  48.06 
 
 
434 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  45.63 
 
 
419 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  48.13 
 
 
432 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  48.21 
 
 
417 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  48.91 
 
 
414 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  47.73 
 
 
420 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  49.15 
 
 
417 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  47.83 
 
 
418 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  47.45 
 
 
414 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  47.73 
 
 
417 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  49.14 
 
 
445 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  48.3 
 
 
415 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  48.64 
 
 
415 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  48.42 
 
 
414 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  48.42 
 
 
414 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  46.6 
 
 
415 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  48.66 
 
 
415 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  47.73 
 
 
415 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  47.93 
 
 
415 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  47.18 
 
 
423 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  48.18 
 
 
414 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  48.18 
 
 
414 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  48.4 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  46.27 
 
 
418 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  47.93 
 
 
414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  45.77 
 
 
425 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  46.97 
 
 
419 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  45.71 
 
 
445 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  47.73 
 
 
414 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  47.82 
 
 
414 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  47.7 
 
 
422 aa  358  8e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  47.65 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  43.16 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  48.18 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  47.65 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  47.41 
 
 
415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  45.13 
 
 
421 aa  356  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  43.23 
 
 
417 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>