103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0048 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  61.03 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  60 
 
 		 294 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  59.66 
 
 		 294 aa  315  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  59.31 
 
 		 292 aa  311  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  58.92 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  58.25 
 
 		 292 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  55.86 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  52.41 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  52.28 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  52.07 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  53.42 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  50.69 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  48.49 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  46.55 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  46.37 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  47.78 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 293 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 		 339 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  46.71 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  46.02 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 313 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  47.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  45.67 
 
 		 336 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  47.83 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  46.02 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  47.16 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  51.18 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  46.76 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  48.07 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  41.55 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  42.91 
 
 		 302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  43.19 
 
 		 330 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  38.6 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  42.36 
 
 		 640 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.71 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.11 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  39.72 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.05 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  41.7 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 365 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 363 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.46 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.34 
 
 		 584 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  51.55 
 
 		 120 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  27.32 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  28.19 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  26.52 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  27 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  25.51 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  26.72 
 
 		 420 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  27.59 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.51 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  27.72 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.41 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3306  inner-membrane translocator  26.24 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.605647  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  25.95 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>