More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0018 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  67.68 
 
 		 427 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  67.21 
 
 		 427 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  100 
 
 		 427 aa  884    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  67.68 
 
 		 427 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  67.54 
 
 		 426 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  59.95 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4197  hypothetical protein  58.82 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  59.38 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  59.62 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.88 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.852601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.53 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.18 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.93 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.37 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  56.97 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  54.85 
 
 		 425 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.43 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.85 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  56 
 
 		 423 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.85 
 
 		 425 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.69 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.78 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.63 
 
 		 421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  53.43 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  53.08 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.03 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.71 
 
 		 434 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  51.17 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.42 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.42 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  50.95 
 
 		 410 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5336  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.43 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  52.38 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.48 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.59 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.94 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  50.71 
 
 		 411 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.9 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3655  MiaB-like tRNA modifying enzyme  49.41 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378988  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2929  MiaB-like tRNA modifying enzyme  52.03 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  44.76 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1401  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.02 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.14892  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  44.02 
 
 		 412 aa  364  2e-99  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0785  MiaB family tRNA modification protein  46.27 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2731  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.32 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.549128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.21 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.43 
 
 		 467 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.57 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.34 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  35.28 
 
 		 435 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.6 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  34.36 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.73 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  34.57 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.57 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.36 
 
 		 431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.71 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.47 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.68 
 
 		 450 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  37.04 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  32.02 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  33.65 
 
 		 448 aa  236  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  33.02 
 
 		 450 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  32.94 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  33.02 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  33.02 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  36.04 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  33.02 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  33.02 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  33.02 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  33.02 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  33.02 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.89 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  33.72 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  33.97 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  33.97 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  34.5 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.65 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.09 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  33.67 
 
 		 454 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.2 
 
 		 427 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  32.87 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.44 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  34.8 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.18 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.59 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1402  RNA modification enzyme, MiaB family  33.97 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  34.88 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.79 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  35.04 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.23 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  33.73 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.46 
 
 		 495 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.49 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.09 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.85 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  32.35 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.27 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>