More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0004 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  56.03 
 
 
234 aa  279  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  56.03 
 
 
234 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  54.55 
 
 
231 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  52.16 
 
 
236 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  54.98 
 
 
242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  52.56 
 
 
242 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  51.27 
 
 
245 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  49.79 
 
 
240 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.51 
 
 
235 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  49.34 
 
 
230 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.79 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.64 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.45 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.49 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.98 
 
 
239 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.98 
 
 
232 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.12 
 
 
239 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.29 
 
 
237 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  46.29 
 
 
229 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.92 
 
 
228 aa  206  4e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.29 
 
 
229 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.26 
 
 
231 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.09 
 
 
235 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.35 
 
 
238 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.4 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.4 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.83 
 
 
238 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.58 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.55 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.81 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.59 
 
 
230 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.86 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.4 
 
 
231 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  46.15 
 
 
239 aa  194  9e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.18 
 
 
241 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.18 
 
 
236 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.44 
 
 
239 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.17 
 
 
236 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  52 
 
 
236 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.61 
 
 
237 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 
231 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.04 
 
 
243 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.53 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  45.75 
 
 
246 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  45.04 
 
 
252 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  43.44 
 
 
252 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.91 
 
 
253 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  45.45 
 
 
244 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 
231 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.98 
 
 
242 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.45 
 
 
238 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.85 
 
 
257 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.3 
 
 
230 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  45.34 
 
 
246 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.68 
 
 
243 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.7 
 
 
242 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000048711  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  44.96 
 
 
242 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.07 
 
 
238 aa  184  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.25 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  43.33 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2365  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.21 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000172168  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.15 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.15 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2063  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.74 
 
 
242 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000471549  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2000  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.74 
 
 
242 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000879357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2323  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.74 
 
 
242 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00003917  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2015  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.74 
 
 
242 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.84 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.8 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.32 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.38 
 
 
233 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.55 
 
 
240 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  43.44 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.25 
 
 
243 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  41.6 
 
 
245 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2398  DNA polymerase III subunit epsilon  44.07 
 
 
243 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.39 
 
 
242 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.17 
 
 
267 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.45 
 
 
241 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  43.27 
 
 
233 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  43.27 
 
 
233 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.28 
 
 
237 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.67 
 
 
234 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.83 
 
 
230 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  42.08 
 
 
245 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.28 
 
 
237 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.64 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2256  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.65 
 
 
234 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  55.06 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  43.22 
 
 
244 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2838  DNA polymerase III subunit epsilon  41.91 
 
 
244 aa  178  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.95 
 
 
239 aa  177  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  42.39 
 
 
247 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  42.26 
 
 
244 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  43.46 
 
 
241 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.4 
 
 
235 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.11 
 
 
240 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  41.6 
 
 
244 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>