204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04176 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  100 
 
 
459 aa  954    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  96.73 
 
 
465 aa  927    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  954    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  53.12 
 
 
805 aa  315  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.71 
 
 
732 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.36 
 
 
421 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  46.35 
 
 
810 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  41.84 
 
 
609 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  41.84 
 
 
609 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  40.83 
 
 
734 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  43.11 
 
 
781 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  48.76 
 
 
655 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.79 
 
 
729 aa  193  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.22 
 
 
502 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  38.86 
 
 
853 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.31 
 
 
698 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.19 
 
 
626 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.87 
 
 
683 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  40.42 
 
 
539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  38.36 
 
 
629 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.97 
 
 
822 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  38.2 
 
 
899 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  38.01 
 
 
678 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  41.01 
 
 
587 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.08 
 
 
568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  35.52 
 
 
700 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  36.45 
 
 
705 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.43 
 
 
743 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  37.82 
 
 
743 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  35.13 
 
 
741 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.56 
 
 
685 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  40.43 
 
 
685 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.59 
 
 
754 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  40.43 
 
 
691 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.1 
 
 
765 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.53 
 
 
530 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  34.15 
 
 
638 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.3 
 
 
914 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 
590 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  39.61 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  38.89 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  32.56 
 
 
999 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  36.06 
 
 
851 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.27 
 
 
585 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  36.62 
 
 
481 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  34.39 
 
 
450 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  41.34 
 
 
517 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  37.91 
 
 
517 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  33.48 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  40.22 
 
 
900 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  42.08 
 
 
662 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  44.32 
 
 
722 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  39.5 
 
 
845 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  40.44 
 
 
862 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  28.66 
 
 
666 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  37.31 
 
 
687 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  40.11 
 
 
696 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  40.34 
 
 
603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.04 
 
 
398 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.29 
 
 
723 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  38.25 
 
 
834 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  34.01 
 
 
571 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.72 
 
 
605 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  43.06 
 
 
598 aa  96.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.6 
 
 
603 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37 
 
 
795 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  32.58 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.89 
 
 
748 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  30.41 
 
 
653 aa  84  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  27.21 
 
 
597 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  23.28 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.21 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.18 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
651 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  33 
 
 
803 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  25.59 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  26.42 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 
559 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  32.51 
 
 
599 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  24.46 
 
 
583 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.33 
 
 
530 aa  67.4  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  25.1 
 
 
714 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  25.1 
 
 
714 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  23.64 
 
 
679 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  28.35 
 
 
524 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  30.81 
 
 
523 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  29.12 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.93 
 
 
559 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.61 
 
 
474 aa  63.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  22.62 
 
 
847 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  22.62 
 
 
843 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  23.21 
 
 
844 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  27.14 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  26.73 
 
 
589 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  28.14 
 
 
578 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  22.68 
 
 
844 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.38 
 
 
606 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  22.75 
 
 
792 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  23.43 
 
 
668 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>