35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04041 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  8.1403e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  8.49189e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.03652e-08  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  99.53 
 
 
212 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  99.53 
 
 
212 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.89523e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  98.58 
 
 
212 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.13576e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  99.06 
 
 
212 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.52643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  85.85 
 
 
211 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.52862e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  85.85 
 
 
211 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  8.08092e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  85.38 
 
 
211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.54437e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  85.38 
 
 
211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  2.75862e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  85.38 
 
 
211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  3.09624e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  83.96 
 
 
209 aa  334  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.21219e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  74.3 
 
 
210 aa  306  1e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.62329e-05  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  43.13 
 
 
246 aa  140  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  38.1 
 
 
237 aa  140  2e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  43.13 
 
 
246 aa  140  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  38.21 
 
 
224 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  40.48 
 
 
234 aa  133  2e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.49639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  42.23 
 
 
239 aa  126  2e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.09608e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  39.71 
 
 
237 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  38.79 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  31.03 
 
 
220 aa  70.9  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  3.5664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  37.21 
 
 
250 aa  69.7  3e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  34.12 
 
 
198 aa  65.9  4e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.23038e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  59.57 
 
 
59 aa  56.2  4e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  34.15 
 
 
402 aa  54.3  1e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.83549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  23.46 
 
 
439 aa  53.5  2e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  25 
 
 
470 aa  48.5  8e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  24.87 
 
 
441 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  24.72 
 
 
475 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  24.59 
 
 
473 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  4.94323e-08  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  24.59 
 
 
475 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  24.12 
 
 
468 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  24.59 
 
 
473 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>