287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03963 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  100 
 
 		 485 aa  978    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  99.79 
 
 		 485 aa  977    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  80.29 
 
 		 486 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  99.18 
 
 		 485 aa  971    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  80.29 
 
 		 486 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  978    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  99.18 
 
 		 485 aa  974    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  99.59 
 
 		 485 aa  974    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  80.29 
 
 		 486 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  80.29 
 
 		 486 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  99.79 
 
 		 485 aa  977    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  80.29 
 
 		 486 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 485 aa  978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  66.38 
 
 		 482 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  57.64 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  57.64 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  57.64 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  57.64 
 
 		 493 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  57.85 
 
 		 493 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  57.38 
 
 		 493 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  57.59 
 
 		 493 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  57.59 
 
 		 493 aa  535  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  57.59 
 
 		 493 aa  535  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  57.38 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 		 516 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  34.26 
 
 		 516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.29 
 
 		 527 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  31.63 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  31.42 
 
 		 461 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  31.14 
 
 		 461 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  31.35 
 
 		 544 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  32.23 
 
 		 507 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  30.56 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  29.4 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  31.6 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  28.46 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  29.72 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  28.15 
 
 		 507 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  29.19 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  29.19 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  29.92 
 
 		 516 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  29.19 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  30.1 
 
 		 495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  28.88 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  30.85 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  31.92 
 
 		 463 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  31 
 
 		 506 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  27.52 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  29.75 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  30.57 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 		 507 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  32.11 
 
 		 496 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  31.31 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  28.35 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  29.53 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  31.31 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  30.79 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  30.57 
 
 		 501 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  30.42 
 
 		 461 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  33.01 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  30.57 
 
 		 501 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  30.42 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  30.42 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  30.42 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 		 506 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 		 506 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  30.42 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  30.36 
 
 		 501 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  28.74 
 
 		 517 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  30.36 
 
 		 501 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  30.2 
 
 		 461 aa  193  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  30.36 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  29.95 
 
 		 498 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  28.54 
 
 		 523 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  30.42 
 
 		 461 aa  193  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  30.2 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  30.36 
 
 		 489 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  29.3 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.31 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.61 
 
 		 544 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  30.79 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  30.79 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  31.17 
 
 		 449 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  31.17 
 
 		 449 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  31.18 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  29.71 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  28.3 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  30.58 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  29.35 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  28.54 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  28.29 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  29.27 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  30.67 
 
 		 514 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  30.69 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>