More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03665 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  67.44 
 
 
240 aa  295  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  65.26 
 
 
228 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  67.58 
 
 
226 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  67.12 
 
 
226 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 
226 aa  285  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  64.19 
 
 
236 aa  281  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  66.98 
 
 
240 aa  281  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  65.24 
 
 
223 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  62.96 
 
 
233 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  62.15 
 
 
230 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  61.43 
 
 
230 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  61.43 
 
 
230 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  56.95 
 
 
227 aa  254  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  58.53 
 
 
223 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  57.82 
 
 
231 aa  244  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  60 
 
 
223 aa  242  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  56.19 
 
 
236 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  55.09 
 
 
222 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  53.7 
 
 
222 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  55.45 
 
 
231 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  52.49 
 
 
232 aa  234  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  59.35 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  57.07 
 
 
225 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  53.42 
 
 
239 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  53.42 
 
 
239 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  51.58 
 
 
234 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
247 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  57.35 
 
 
225 aa  225  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  49.78 
 
 
227 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  51.58 
 
 
234 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  52.97 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  52.81 
 
 
230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  48.02 
 
 
230 aa  223  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 
230 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  52.04 
 
 
233 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  48.68 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  52.65 
 
 
233 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  50.88 
 
 
241 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  49.1 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  48.9 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  49.55 
 
 
232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  47.98 
 
 
389 aa  211  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  44.36 
 
 
281 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  43.06 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  41.4 
 
 
240 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.18 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.65 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.27 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.27 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.27 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.27 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.82 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.58 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
264 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.12 
 
 
241 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.32 
 
 
244 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
230 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
233 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.56 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.11 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.08 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 
245 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.7 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  30.36 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  27.35 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.52 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>