140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03537 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  100 
 
 		 415 aa  821    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  99.52 
 
 		 415 aa  818    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  99.52 
 
 		 413 aa  812    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  821    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  99.52 
 
 		 415 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  100 
 
 		 415 aa  821    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  100 
 
 		 415 aa  821    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  99.28 
 
 		 415 aa  817    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  53.16 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  51.95 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  53.09 
 
 		 414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  52.84 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  53.09 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  52.84 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  52.84 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  48.54 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  48.55 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  45.91 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  45.91 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  46.44 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  45.95 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  47.56 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  47.17 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  46.63 
 
 		 418 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  46.49 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  46.49 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  46.63 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  46.62 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  45.04 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  43.45 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  47.91 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  43.2 
 
 		 414 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  43.96 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  43.2 
 
 		 412 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  48.07 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  45.93 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  46.39 
 
 		 418 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  46.52 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  44.5 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  38.59 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  39.85 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  40.63 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  39.66 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  33.01 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  30.32 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  33.09 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  33.09 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  33.66 
 
 		 402 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  33.99 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  30.34 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  28.61 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  30.56 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  31.22 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  30.4 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  30.15 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  31.06 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  28.89 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  29.9 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  29.47 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  29.78 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  29.15 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  28.89 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  28.89 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  32.1 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  29.85 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  30.25 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  30.03 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  32.11 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  29.16 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  28.64 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  27.92 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  29.15 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  28.91 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  27.17 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  28.91 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  28.65 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>