222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03411 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  100 
 
 		 1616 aa  3137    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  97.03 
 
 		 753 aa  1368    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  56.35 
 
 		 1447 aa  1302    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  100 
 
 		 1616 aa  3137    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  57.12 
 
 		 1446 aa  1291    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  66.83 
 
 		 1549 aa  1862    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  70.02 
 
 		 1674 aa  2053    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  55.11 
 
 		 1472 aa  1278    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  58.5 
 
 		 1342 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  56.25 
 
 		 1447 aa  1301    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  93.94 
 
 		 1588 aa  2805    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  97.96 
 
 		 1616 aa  2952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  97.77 
 
 		 279 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  47.8 
 
 		 1713 aa  277  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.79 
 
 		 1117 aa  270  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  28.66 
 
 		 1326 aa  230  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  29.02 
 
 		 4191 aa  216  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  40.94 
 
 		 1434 aa  211  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  31.8 
 
 		 2396 aa  210  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  38.29 
 
 		 1353 aa  209  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.61 
 
 		 1854 aa  208  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  28.49 
 
 		 1613 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  33.91 
 
 		 716 aa  204  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  28.54 
 
 		 1309 aa  202  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  31.85 
 
 		 877 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  33.97 
 
 		 1471 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  33.97 
 
 		 1471 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  33.28 
 
 		 716 aa  199  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  33.8 
 
 		 1546 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  34.16 
 
 		 880 aa  191  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  33.69 
 
 		 876 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  36.33 
 
 		 4726 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.38 
 
 		 878 aa  183  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.29 
 
 		 831 aa  178  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 816 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 816 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 816 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 820 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 831 aa  176  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 831 aa  176  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  34.87 
 
 		 816 aa  176  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  34.44 
 
 		 2141 aa  169  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  31.13 
 
 		 963 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  29.44 
 
 		 1090 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  29.44 
 
 		 1090 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  29.44 
 
 		 1090 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  29.38 
 
 		 1122 aa  166  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  29.38 
 
 		 1122 aa  165  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  29.38 
 
 		 1122 aa  165  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  29.44 
 
 		 1074 aa  165  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  35.26 
 
 		 3635 aa  158  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  30.19 
 
 		 2504 aa  155  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.87 
 
 		 1440 aa  154  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  39.55 
 
 		 827 aa  153  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  30.65 
 
 		 1190 aa  152  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  31.8 
 
 		 472 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  38.81 
 
 		 617 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  30.3 
 
 		 2157 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  30.49 
 
 		 1390 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  27.07 
 
 		 1197 aa  148  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  27.07 
 
 		 1197 aa  148  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  32.25 
 
 		 1411 aa  147  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  26.75 
 
 		 1197 aa  146  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  33.33 
 
 		 691 aa  145  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  46.52 
 
 		 1487 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  32.28 
 
 		 1265 aa  143  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  30.09 
 
 		 3192 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  40.82 
 
 		 2868 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  40.85 
 
 		 1012 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  40.85 
 
 		 1068 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  30.69 
 
 		 2832 aa  140  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  34.63 
 
 		 330 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  40.85 
 
 		 962 aa  138  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  36.84 
 
 		 601 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  34 
 
 		 650 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  34.07 
 
 		 4384 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.94 
 
 		 1230 aa  137  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  32.67 
 
 		 3718 aa  135  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  36.16 
 
 		 735 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  30.25 
 
 		 1333 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  40.94 
 
 		 1186 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  31.01 
 
 		 1072 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  34.48 
 
 		 810 aa  129  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  25.56 
 
 		 1235 aa  128  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.05 
 
 		 536 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  37.62 
 
 		 1417 aa  123  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  28.83 
 
 		 2095 aa  122  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  31.51 
 
 		 1814 aa  120  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  27.9 
 
 		 3126 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  28.35 
 
 		 575 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  31.34 
 
 		 548 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  32.01 
 
 		 1125 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  31.44 
 
 		 1204 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  30.06 
 
 		 597 aa  112  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  33.53 
 
 		 990 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.08 
 
 		 1246 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  31.27 
 
 		 597 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  31.27 
 
 		 597 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  36.65 
 
 		 2392 aa  110  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  31.23 
 
 		 1451 aa  108  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>