More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03074 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  100 
 
 
385 aa  785    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.74 
 
 
385 aa  783    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  98.7 
 
 
385 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  99.74 
 
 
385 aa  783    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  99.48 
 
 
385 aa  782    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  99.48 
 
 
385 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  88.13 
 
 
385 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  88.42 
 
 
385 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  785    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  99.74 
 
 
385 aa  783    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  99.74 
 
 
385 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  88.42 
 
 
385 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  88.42 
 
 
385 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  73.96 
 
 
379 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.72 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  69.07 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.07 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  69.33 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  69.07 
 
 
409 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  69.07 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  69.07 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  69.07 
 
 
409 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  69.07 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  69.07 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  61.93 
 
 
395 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  61.93 
 
 
395 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  62.86 
 
 
388 aa  497  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  65.43 
 
 
395 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  64.53 
 
 
397 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  68.18 
 
 
397 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  68.18 
 
 
397 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  68.18 
 
 
397 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  68.18 
 
 
397 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  68.18 
 
 
397 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.07 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  63.69 
 
 
390 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.08 
 
 
398 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.3 
 
 
397 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  57.02 
 
 
392 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.08 
 
 
422 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  57.3 
 
 
400 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.08 
 
 
433 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.11 
 
 
399 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  53.41 
 
 
383 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  52.02 
 
 
405 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  52.66 
 
 
381 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  53.13 
 
 
442 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  53.85 
 
 
386 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  49.21 
 
 
385 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  54.32 
 
 
395 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  51.68 
 
 
386 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  48.95 
 
 
385 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  48.95 
 
 
385 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  53.89 
 
 
400 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  55.33 
 
 
394 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.96 
 
 
386 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  50.96 
 
 
379 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  51.91 
 
 
382 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  51.79 
 
 
384 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.24 
 
 
384 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  51.24 
 
 
384 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  50.96 
 
 
384 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.99 
 
 
410 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  50.92 
 
 
394 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  52.14 
 
 
412 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  49.6 
 
 
387 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  51.4 
 
 
420 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.4 
 
 
420 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.4 
 
 
420 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.4 
 
 
420 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.4 
 
 
420 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  52.66 
 
 
409 aa  345  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
383 aa  345  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.72 
 
 
386 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.12 
 
 
420 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  48.27 
 
 
418 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  48.27 
 
 
418 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.28 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.57 
 
 
411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  51.96 
 
 
394 aa  342  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  51.12 
 
 
420 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  48.27 
 
 
418 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  49.2 
 
 
423 aa  342  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  49.72 
 
 
425 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  50.84 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  47.61 
 
 
426 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  52.47 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  50.41 
 
 
385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  49.58 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.58 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  47.89 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  52.48 
 
 
378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
381 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  51.46 
 
 
398 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>