More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03036 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  99.66 
 
 		 297 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  90.91 
 
 		 297 aa  561  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  90.57 
 
 		 297 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  90.24 
 
 		 297 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  90.24 
 
 		 297 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  90.24 
 
 		 297 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  90.24 
 
 		 297 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  42.91 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  39.85 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 288 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  37.5 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  37.02 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  37.02 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  37.67 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  36.95 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  32.25 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  31.76 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3485  dihydrodipicolinate synthetase  32.33 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  32.7 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  33.68 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.76 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  29.43 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  30.47 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.88 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  29.8 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  31.42 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  31.28 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  30.71 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  31.2 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  30.4 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  31.12 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  34.78 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  34.45 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.72 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  28.16 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  28.16 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  28.16 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  28.16 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  29.36 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  31.44 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>