More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02613 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  1017    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  1017    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  56.01 
 
 
494 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  54.73 
 
 
501 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  54.95 
 
 
512 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  55.08 
 
 
513 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.75 
 
 
512 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  54.27 
 
 
514 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  54.08 
 
 
512 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  54.75 
 
 
513 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  54.08 
 
 
512 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  53.83 
 
 
524 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  53.94 
 
 
504 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  53.85 
 
 
503 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  52.85 
 
 
513 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  52.14 
 
 
516 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  52.23 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  52.55 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  52.23 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  53.04 
 
 
503 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  53.09 
 
 
514 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  53 
 
 
504 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  53.46 
 
 
508 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  52.44 
 
 
499 aa  505  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  51.09 
 
 
507 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  51.5 
 
 
500 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  50.81 
 
 
501 aa  501  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  51.41 
 
 
520 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  50.71 
 
 
515 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
498 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  50.7 
 
 
517 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  52.62 
 
 
500 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  51.41 
 
 
505 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 
494 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
504 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  49.59 
 
 
525 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  50.2 
 
 
506 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.39 
 
 
525 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 
501 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  51.53 
 
 
501 aa  480  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  48.89 
 
 
524 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  48.89 
 
 
524 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.09 
 
 
527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.98 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  50.71 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  48.69 
 
 
524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  50 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  50 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  50 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  50 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  50 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  50 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  48.69 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  49.4 
 
 
513 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  47.57 
 
 
523 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  47.98 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 
506 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  49.7 
 
 
511 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  49.8 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  48.29 
 
 
524 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  49.19 
 
 
501 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  49.8 
 
 
501 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  49.19 
 
 
516 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  49.19 
 
 
516 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  49.29 
 
 
501 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  49.19 
 
 
516 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.59 
 
 
524 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  49.19 
 
 
516 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  48.79 
 
 
496 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
496 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 
508 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
525 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.79 
 
 
496 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  48.1 
 
 
516 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  48.79 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  49.4 
 
 
512 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  48.48 
 
 
513 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.47 
 
 
518 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
496 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  50.4 
 
 
495 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  49.8 
 
 
501 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  49.49 
 
 
501 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 
515 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  50 
 
 
500 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  48.99 
 
 
501 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  47.79 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  47.36 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.36 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.36 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.67 
 
 
521 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  48.49 
 
 
495 aa  451  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  49.4 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  47.8 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  47.27 
 
 
497 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  48.19 
 
 
506 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
494 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>