More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02610 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  100 
 
 		 542 aa  1081    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1083    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  61.14 
 
 		 528 aa  657    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  43.83 
 
 		 545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  42.25 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  42.25 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  42.07 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  44.83 
 
 		 547 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  44.11 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  45.2 
 
 		 526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  44.13 
 
 		 543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  42.78 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  42.13 
 
 		 538 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  42.67 
 
 		 547 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  41.84 
 
 		 529 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  40.93 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  40.93 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  42.19 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  43.69 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  41.65 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  41.17 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  42.37 
 
 		 545 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  39.85 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  41.4 
 
 		 544 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  41.21 
 
 		 544 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  39.44 
 
 		 544 aa  353  5e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  38.56 
 
 		 523 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  40.49 
 
 		 540 aa  349  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 603 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  36.75 
 
 		 758 aa  303  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  35.92 
 
 		 621 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  37.33 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  31.72 
 
 		 502 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  32.78 
 
 		 541 aa  246  8e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  31.33 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  31.3 
 
 		 501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  31.3 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  32.06 
 
 		 482 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  28.01 
 
 		 556 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.67 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.16 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  26.78 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  26.78 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  28.57 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  27.94 
 
 		 562 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  30.62 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  29.49 
 
 		 585 aa  154  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  28.65 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.67 
 
 		 506 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  28.07 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  28.94 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  28.82 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  29.9 
 
 		 564 aa  147  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.27 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  27.73 
 
 		 562 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  27.84 
 
 		 570 aa  143  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  29.53 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  26.13 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  29.21 
 
 		 551 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  24.28 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  29.34 
 
 		 598 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  25.49 
 
 		 536 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  26.73 
 
 		 505 aa  136  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  23.87 
 
 		 506 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.94 
 
 		 501 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  27.52 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  31.95 
 
 		 567 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  27.57 
 
 		 557 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  28.93 
 
 		 557 aa  133  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  25.2 
 
 		 499 aa  133  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  29.06 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  28.24 
 
 		 557 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  28.57 
 
 		 506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  27.89 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  30.34 
 
 		 572 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.16 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  24.62 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  27.11 
 
 		 553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35001  Ribulokinase-like protein  25.86 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  25.89 
 
 		 511 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  24.48 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  28.33 
 
 		 508 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.54 
 
 		 509 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  21.88 
 
 		 496 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  23.91 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  25.93 
 
 		 505 aa  124  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25.66 
 
 		 495 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  28.46 
 
 		 495 aa  123  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  29.35 
 
 		 579 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  28.72 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  27.49 
 
 		 556 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.87 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  23.51 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  23.36 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  23.38 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  24.01 
 
 		 514 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  24.95 
 
 		 521 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  21.66 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  23.4 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  25.89 
 
 		 548 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>