More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02297 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02335  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  100 
 
 
289 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1226  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
289 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02297  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1244  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  100 
 
 
289 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2807  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  99.65 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3665  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  99.65 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.353577  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2721  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  99.65 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2590  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  98.62 
 
 
289 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2572  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  98.96 
 
 
289 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2816  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  92.39 
 
 
289 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2710  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  92.73 
 
 
289 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2644  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  92.73 
 
 
289 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2686  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  92.73 
 
 
289 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148048  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2595  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  92.73 
 
 
289 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2956  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  90 
 
 
291 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.702155  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3463  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  65.03 
 
 
299 aa  361  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3384  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.8 
 
 
414 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0920  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.39 
 
 
414 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3140  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  48.31 
 
 
419 aa  224  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3216  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.72 
 
 
526 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0746  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.64 
 
 
522 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.07 
 
 
412 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00703451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3045  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0874  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02626  hypothetical protein  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2963  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2964  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3137  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.46 
 
 
417 aa  222  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
515 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3228  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0709021  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0994  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.367182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1952  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.44 
 
 
503 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.44 
 
 
504 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0733  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.86 
 
 
505 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1046  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
416 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0326494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.28 
 
 
413 aa  218  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.695553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.01 
 
 
508 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.095859  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
514 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, AMIC precursor protein  48.28 
 
 
514 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0910  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
518 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2482  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.58 
 
 
515 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0672514 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2500  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
514 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0843  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.18 
 
 
399 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.807823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.18 
 
 
405 aa  217  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0677678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0907  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
518 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2611  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.58 
 
 
505 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
514 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.292024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5895  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.58 
 
 
508 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 
514 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.59 
 
 
475 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.64 
 
 
443 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2670  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.64 
 
 
447 aa  215  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.2261  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3811  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.55 
 
 
417 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145796  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0526  cell wall hydrolase/autolysin  49.32 
 
 
497 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.57 
 
 
448 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2016  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.01 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3260  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.81 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.7 
 
 
418 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2027  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.18 
 
 
454 aa  212  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1274  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.84 
 
 
497 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.730541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.38 
 
 
471 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0337  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.51 
 
 
472 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000027639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.23 
 
 
456 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
472 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AMIC precursor protein  48.4 
 
 
507 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 
483 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.7 
 
 
475 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3049  cell wall hydrolase/autolysin  46.78 
 
 
449 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.0314787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5676  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.7 
 
 
487 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.538418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5127  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.11 
 
 
496 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498717  normal  0.873024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 
482 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.951769  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  48.96 
 
 
471 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0584  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.77 
 
 
499 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.95 
 
 
443 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.12 
 
 
448 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4949  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.66 
 
 
476 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0480001  normal  0.137764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.43 
 
 
474 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.125384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3199  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.09 
 
 
471 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.384074  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2409  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.58 
 
 
507 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262199  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2753  hypothetical protein  48.44 
 
 
476 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2626  hypothetical protein  48.44 
 
 
476 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.89 
 
 
523 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.418715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2635  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.73 
 
 
442 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000028113  unclonable  0.00000000000694269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4897  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.78 
 
 
476 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019111  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4773  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.78 
 
 
476 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2815  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.15 
 
 
506 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.78 
 
 
477 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1170  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.18 
 
 
519 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0759959  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1262  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.03 
 
 
452 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.826709  normal  0.137617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.83 
 
 
471 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.419176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1783  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.62 
 
 
465 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29220  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.57 
 
 
396 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5657  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.92 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.55 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  43.2 
 
 
407 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73040  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.43 
 
 
397 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.487189  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.08 
 
 
408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>