99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01959 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  98.87 
 
 		 617 aa  1244    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  98.87 
 
 		 617 aa  1244    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  98.7 
 
 		 617 aa  1243    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  98.87 
 
 		 617 aa  1244    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  98.7 
 
 		 617 aa  1242    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  76.05 
 
 		 618 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  76.05 
 
 		 618 aa  991    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  76.05 
 
 		 618 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  76.05 
 
 		 618 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  76.21 
 
 		 618 aa  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  98.7 
 
 		 617 aa  1240    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  98.54 
 
 		 617 aa  1238    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  67.91 
 
 		 615 aa  883    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1257    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  100 
 
 		 617 aa  1257    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  48.71 
 
 		 611 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  47.98 
 
 		 611 aa  582  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  47.82 
 
 		 611 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  46.08 
 
 		 618 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  46.08 
 
 		 618 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  46.08 
 
 		 618 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  43 
 
 		 599 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  44.02 
 
 		 604 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.41 
 
 		 606 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  25 
 
 		 606 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.66 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.49 
 
 		 606 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.45 
 
 		 607 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  24.03 
 
 		 614 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  23.7 
 
 		 607 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  23.01 
 
 		 607 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.89 
 
 		 607 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  23.86 
 
 		 604 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.79 
 
 		 612 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  22.42 
 
 		 611 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.64 
 
 		 608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  22.11 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  22.04 
 
 		 606 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  25.13 
 
 		 695 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  26.74 
 
 		 695 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.73 
 
 		 699 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  20.96 
 
 		 719 aa  107  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  23 
 
 		 703 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21.4 
 
 		 696 aa  97.8  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  23.41 
 
 		 712 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.73 
 
 		 742 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.78 
 
 		 812 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.74 
 
 		 640 aa  87.4  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  23.19 
 
 		 732 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.44 
 
 		 797 aa  74.7  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  20.75 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  21.53 
 
 		 794 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.2 
 
 		 893 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  20.87 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  20.9 
 
 		 602 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  22.14 
 
 		 826 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  20.55 
 
 		 649 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  20.75 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  19.15 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  23.91 
 
 		 649 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  20.52 
 
 		 711 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  20.36 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  22.35 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  20.78 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  21.12 
 
 		 747 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.05 
 
 		 705 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  20.34 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  20.28 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  21.24 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  21.72 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  21.33 
 
 		 748 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  21.09 
 
 		 646 aa  55.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  21.76 
 
 		 748 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  21.54 
 
 		 748 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  20.57 
 
 		 1013 aa  54.3  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  20.67 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  18.12 
 
 		 750 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.24 
 
 		 704 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.06 
 
 		 677 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  28.89 
 
 		 640 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  19.44 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  20.41 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.56 
 
 		 1077 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  18.42 
 
 		 701 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  18.12 
 
 		 750 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  19.69 
 
 		 611 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  19.38 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.65 
 
 		 609 aa  48.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  29.41 
 
 		 502 aa  48.1  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  29.41 
 
 		 508 aa  48.1  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.12 
 
 		 675 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.73 
 
 		 649 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  29.21 
 
 		 741 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.91 
 
 		 645 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22 
 
 		 660 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22 
 
 		 660 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  21.88 
 
 		 649 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  28.09 
 
 		 741 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>