9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01872 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01882  chaperone protein HchA  99.85 
 
 
660 bp  1265    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1684  ThiJ/PfpI domain protein  98.14 
 
 
852 bp  1178    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000959624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2068  chaperone protein HchA  97.99 
 
 
852 bp  1170    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000391461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2198  chaperone protein HchA  98.3 
 
 
852 bp  1185    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1678  chaperone protein HchA  97.83 
 
 
852 bp  1162    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1218  chaperone protein HchA  98.14 
 
 
852 bp  1178    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00819366  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0916  chaperone protein HchA  98.14 
 
 
852 bp  1178    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000778732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2746  chaperone protein HchA  97.99 
 
 
852 bp  1170    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01872    100 
 
 
646 bp  1281    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000490701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>