25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01868 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  99.22 
 
 		 1833 bp  1233    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01868    100 
 
 		 642 bp  1273    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000039643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  99.38 
 
 		 1833 bp  1241    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  99.38 
 
 		 1833 bp  1241    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  98.75 
 
 		 1833 bp  1209    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  98.44 
 
 		 1833 bp  1193    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  99.38 
 
 		 1833 bp  1241    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 1833 bp  1273    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 1767 bp  1142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  83.3 
 
 		 1833 bp  387  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  83.3 
 
 		 1833 bp  387  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  82.8 
 
 		 1833 bp  367  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  83.58 
 
 		 1833 bp  365  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  82.79 
 
 		 1833 bp  363  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  82.68 
 
 		 1824 bp  341  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  79.21 
 
 		 1833 bp  194  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  80.53 
 
 		 1833 bp  149  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  80.07 
 
 		 1833 bp  113  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  78.59 
 
 		 1833 bp  109  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  83.46 
 
 		 1833 bp  89.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  83.46 
 
 		 1854 bp  89.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  83.46 
 
 		 1854 bp  89.7  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  86.15 
 
 		 1833 bp  58  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  92.11 
 
 		 1827 bp  52  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 1824 bp  52  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>