More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01759 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01771  predicted transporter  100 
 
 
481 aa  970    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1842  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
476 aa  962    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.220871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1618  putative transporter  79.21 
 
 
548 aa  752    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1754  putative transporter  78.99 
 
 
548 aa  752    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000362629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1387  putative transporter  99.58 
 
 
536 aa  971    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.216138  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2527  putative transporter  99.58 
 
 
536 aa  971    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.951849  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01759  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  970    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1515  putative transporter  79.21 
 
 
548 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2027  putative transporter  99.58 
 
 
536 aa  972    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.12575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1889  putative transporter  99.58 
 
 
536 aa  972    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1832  putative transporter  100 
 
 
481 aa  970    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.301874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2195  putative transporter  66 
 
 
532 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.528619  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3857  putative transporter  47.86 
 
 
548 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.187176  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000396  choline-glycine betaine transporter  35.17 
 
 
593 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2691  choline transporter  35.73 
 
 
540 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2637  choline transporter  35.73 
 
 
540 aa  302  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03056  hypothetical protein  35.15 
 
 
632 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2179  choline/carnitine/betaine transporter  34.89 
 
 
540 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4071  choline/carnitine/betaine transporter  33.98 
 
 
650 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00106  putative choline-glycine betaine transporter  32.61 
 
 
586 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4104  choline/carnitine/betaine transporter  33.54 
 
 
650 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1338  choline/carnitine/betaine transporter  34.03 
 
 
542 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0014  choline/carnitine/betaine transporter  32.38 
 
 
584 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4909  choline/carnitine/betaine transporter  33.91 
 
 
527 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3247  BCCT transporter  28.19 
 
 
532 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1731  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.87 
 
 
508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0569  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  28.34 
 
 
507 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3559  choline/carnitine/betaine transporter  29.45 
 
 
504 aa  233  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0042  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
504 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
504 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3615  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
504 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0041  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
504 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.206145  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
504 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00043  hypothetical protein  29.45 
 
 
504 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.721093  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0081  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
505 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
505 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0082  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
505 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.508572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
505 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0080  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 
505 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.682648  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2342  BCCT transporter  32.02 
 
 
525 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29 
 
 
504 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.03 
 
 
490 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  32.36 
 
 
503 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  34.55 
 
 
508 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  31.28 
 
 
523 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1261  choline/carnitine/betaine transporter family protein  29.45 
 
 
522 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  31.97 
 
 
520 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  31.97 
 
 
520 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  29.85 
 
 
606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  30.85 
 
 
550 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  29.84 
 
 
505 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  29.84 
 
 
505 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  31.39 
 
 
498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  29.62 
 
 
505 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  29.62 
 
 
505 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  29.62 
 
 
505 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  29.62 
 
 
505 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  30.29 
 
 
504 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  29.84 
 
 
505 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  29.84 
 
 
504 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  29.89 
 
 
504 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  30.47 
 
 
544 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 
558 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.5 
 
 
530 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.62 
 
 
551 aa  207  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  30.26 
 
 
514 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4862  putative carnitine transporter CglC  28.57 
 
 
513 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.905862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  30.28 
 
 
516 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  32.58 
 
 
532 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4038  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  26.19 
 
 
519 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  29.5 
 
 
505 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  31.43 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  31.43 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  31.43 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  29.42 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3229  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  25.61 
 
 
514 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  30.22 
 
 
516 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  30.94 
 
 
542 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2676  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  26.13 
 
 
514 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  30.99 
 
 
516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  30 
 
 
516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  31.21 
 
 
516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  31.21 
 
 
516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  31.1 
 
 
525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  31.48 
 
 
533 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  31.89 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  29.05 
 
 
543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  32.7 
 
 
525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  29.61 
 
 
659 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  29.78 
 
 
516 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  29.61 
 
 
659 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  30.85 
 
 
573 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  30.8 
 
 
657 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  31.39 
 
 
582 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 
582 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  31.39 
 
 
582 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  30.77 
 
 
531 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  28.63 
 
 
679 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  30.04 
 
 
577 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  29.53 
 
 
531 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>