154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01488 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  624  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  624  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  99.67 
 
 
321 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  99.67 
 
 
304 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  99.01 
 
 
304 aa  617  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  99.67 
 
 
304 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  81.91 
 
 
304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  63.28 
 
 
305 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  42.72 
 
 
318 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  42.33 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  42.76 
 
 
312 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  43 
 
 
308 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  41.98 
 
 
303 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  44.12 
 
 
302 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  40.39 
 
 
306 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  40.39 
 
 
306 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  40.39 
 
 
306 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  41.06 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  41.39 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  42.81 
 
 
308 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  40.52 
 
 
306 aa  231  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  39.74 
 
 
306 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  41.97 
 
 
308 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  39.22 
 
 
308 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  38.76 
 
 
306 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  39.09 
 
 
306 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  42.76 
 
 
306 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  39.24 
 
 
315 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  41.75 
 
 
303 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  38.94 
 
 
305 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  44.04 
 
 
302 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  39.14 
 
 
303 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  39.55 
 
 
314 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  39.09 
 
 
306 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  39.8 
 
 
310 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  38.54 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  41.1 
 
 
306 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  41.1 
 
 
306 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  40.07 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  40.66 
 
 
307 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  38.56 
 
 
308 aa  219  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  39.62 
 
 
306 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  39.18 
 
 
306 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  39.62 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  39.62 
 
 
306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  39.67 
 
 
307 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  41.91 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  40.32 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  38.76 
 
 
308 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  37.46 
 
 
299 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  39.48 
 
 
303 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  37.25 
 
 
299 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  38.74 
 
 
298 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  37.04 
 
 
299 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  36.7 
 
 
299 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  34.33 
 
 
299 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  39.07 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  38.87 
 
 
306 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  38.74 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  37.87 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  35.33 
 
 
299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  38.52 
 
 
304 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  38.64 
 
 
306 aa  191  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  38.51 
 
 
300 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  38.31 
 
 
306 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  36.62 
 
 
296 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  33.8 
 
 
296 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  38.98 
 
 
286 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  35.62 
 
 
272 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  33.57 
 
 
321 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  32.98 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  32.98 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  33.22 
 
 
277 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  32.03 
 
 
315 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  30.46 
 
 
310 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  35.17 
 
 
314 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  30.2 
 
 
300 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  30.85 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  33.81 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  30.87 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  32.08 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  30.52 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  31.91 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  29.28 
 
 
295 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  31.49 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  29.66 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  37.67 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  31.49 
 
 
307 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>