More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01400 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  100 
 
 
402 aa  839    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
382 aa  798    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  98.76 
 
 
402 aa  829    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  79.8 
 
 
402 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  99.5 
 
 
402 aa  834    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  96.52 
 
 
402 aa  806    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  97.16 
 
 
387 aa  782    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  97.51 
 
 
402 aa  815    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  97.76 
 
 
402 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  97.51 
 
 
402 aa  816    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
382 aa  798    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  97.01 
 
 
402 aa  811    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  97.01 
 
 
402 aa  810    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  839    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  97.26 
 
 
402 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  62.37 
 
 
400 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  58.05 
 
 
411 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  60.1 
 
 
403 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  59.22 
 
 
411 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  59.06 
 
 
411 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.47 
 
 
406 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  59.95 
 
 
403 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  60.21 
 
 
403 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  58.23 
 
 
413 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  57.07 
 
 
411 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  58.05 
 
 
411 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  64.32 
 
 
399 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  56.25 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  55.89 
 
 
422 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  57.88 
 
 
348 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  57.88 
 
 
348 aa  423  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  57.31 
 
 
348 aa  421  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.74 
 
 
435 aa  365  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  43.23 
 
 
422 aa  349  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  45.43 
 
 
381 aa  345  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  45.17 
 
 
381 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  46.53 
 
 
408 aa  342  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  46.04 
 
 
408 aa  339  5e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  57.52 
 
 
231 aa  277  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  58.26 
 
 
219 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  38.82 
 
 
397 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  38.82 
 
 
397 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.71 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.97 
 
 
416 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.56 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.64 
 
 
415 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.02 
 
 
395 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.46 
 
 
396 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.9 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.44 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.37 
 
 
401 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.34 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.34 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.32 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.67 
 
 
416 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  35.59 
 
 
399 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.25 
 
 
410 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.07 
 
 
361 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.19 
 
 
424 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  36.18 
 
 
429 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.03 
 
 
373 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.55 
 
 
368 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  36.06 
 
 
398 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.41 
 
 
393 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  33.42 
 
 
385 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.41 
 
 
393 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  36.06 
 
 
398 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  34.35 
 
 
383 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  35.03 
 
 
377 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.72 
 
 
381 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.49 
 
 
373 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  34.49 
 
 
373 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  36.06 
 
 
398 aa  206  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  34.1 
 
 
383 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.04 
 
 
372 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.04 
 
 
373 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  35.11 
 
 
410 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.84 
 
 
383 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.41 
 
 
402 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.88 
 
 
386 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.22 
 
 
372 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.76 
 
 
391 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.76 
 
 
391 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.22 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.22 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.22 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.65 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.75 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.22 
 
 
373 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.22 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
409 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.47 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  32.98 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 
383 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 
391 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  33.92 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  36.06 
 
 
377 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.24 
 
 
383 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>