66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01323 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  99.8 
 
 
508 aa  998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  100 
 
 
508 aa  1000    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  75.45 
 
 
505 aa  745    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1000    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  75.74 
 
 
507 aa  776    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.61 
 
 
510 aa  996    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.41 
 
 
510 aa  994    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.61 
 
 
508 aa  996    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  70.22 
 
 
508 aa  735    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  99.61 
 
 
508 aa  996    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  100 
 
 
508 aa  1000    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  99.01 
 
 
305 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  98.54 
 
 
263 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  41.85 
 
 
512 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  35.71 
 
 
518 aa  361  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  39.24 
 
 
506 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  38.67 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  37.53 
 
 
511 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  37.94 
 
 
538 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  36.14 
 
 
520 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  38.03 
 
 
538 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  37.91 
 
 
519 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  37.28 
 
 
537 aa  323  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  38.4 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  36.55 
 
 
518 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  39.88 
 
 
535 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  39.88 
 
 
535 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  35.51 
 
 
512 aa  317  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  35.51 
 
 
512 aa  317  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  39.68 
 
 
535 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  38.22 
 
 
525 aa  316  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  37.28 
 
 
539 aa  315  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  35.18 
 
 
519 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  37.48 
 
 
539 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  39.28 
 
 
540 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  39.28 
 
 
540 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  34.78 
 
 
519 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  35.34 
 
 
512 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  39.08 
 
 
540 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  34.58 
 
 
519 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  34.89 
 
 
519 aa  309  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  36.89 
 
 
534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  38.88 
 
 
530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  38.2 
 
 
532 aa  302  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  39.08 
 
 
511 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  38.4 
 
 
534 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  34.28 
 
 
515 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  38.8 
 
 
528 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  38.88 
 
 
522 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  35.62 
 
 
529 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  34.13 
 
 
519 aa  296  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  34.06 
 
 
585 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  32.04 
 
 
514 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  32.15 
 
 
520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  33.33 
 
 
523 aa  267  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  33.6 
 
 
519 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  33.6 
 
 
519 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  33.6 
 
 
519 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  33.13 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  33.73 
 
 
519 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  29.76 
 
 
509 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  33.4 
 
 
518 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  33.4 
 
 
518 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  30.68 
 
 
552 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1855  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter-like protein  85.45 
 
 
88 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3467  hypothetical protein  22.58 
 
 
240 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0456304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>