More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01146 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  100 
 
 
403 aa  830    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  99.5 
 
 
403 aa  827    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  98.51 
 
 
403 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  99.5 
 
 
403 aa  827    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  99.5 
 
 
403 aa  827    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  99.5 
 
 
403 aa  827    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  830    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  63.87 
 
 
418 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  45.48 
 
 
406 aa  362  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  33.17 
 
 
390 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  36.09 
 
 
291 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  35.84 
 
 
266 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  36.84 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  32.22 
 
 
254 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  31.84 
 
 
257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  30.49 
 
 
254 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  33.06 
 
 
256 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  33.06 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  31.6 
 
 
239 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  32.65 
 
 
260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  30.87 
 
 
262 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  33.06 
 
 
263 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 
255 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 
252 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
257 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  34.07 
 
 
257 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  30.57 
 
 
256 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  32.24 
 
 
248 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  30.53 
 
 
253 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  32.44 
 
 
258 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 
258 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 
246 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 
246 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  29.26 
 
 
259 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  32.16 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  27.93 
 
 
601 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  29.2 
 
 
283 aa  106  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  31.98 
 
 
257 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  31.98 
 
 
257 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  27.48 
 
 
582 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  29.2 
 
 
265 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  29.2 
 
 
265 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  31.53 
 
 
257 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  29.44 
 
 
356 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  27.31 
 
 
360 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  26.85 
 
 
362 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 
258 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  29.86 
 
 
259 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  30.63 
 
 
257 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.48 
 
 
596 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  31.34 
 
 
249 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.28 
 
 
590 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  26.01 
 
 
590 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.38 
 
 
584 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.54 
 
 
585 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.54 
 
 
585 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1106  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.22 
 
 
764 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0307907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.54 
 
 
585 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  28.76 
 
 
284 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.54 
 
 
585 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  28.25 
 
 
367 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  29.2 
 
 
475 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  25.23 
 
 
590 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  27.85 
 
 
371 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.85 
 
 
599 aa  92.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.48 
 
 
699 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.56 
 
 
584 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0050  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.01 
 
 
742 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  30.88 
 
 
257 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  31.19 
 
 
259 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.99 
 
 
583 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.99 
 
 
583 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.97 
 
 
584 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  27.47 
 
 
584 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.64 
 
 
715 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1335  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.67 
 
 
920 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0583  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.64 
 
 
743 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0159  GGDEF domain-containing protein  30.38 
 
 
742 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.43432  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  25.81 
 
 
592 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.36 
 
 
565 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  24.66 
 
 
352 aa  90.5  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 
883 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  28.64 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 
224 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.65 
 
 
797 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.3 
 
 
745 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.05 
 
 
633 aa  89  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.87 
 
 
800 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01495  sensory box/GGDEF family protein  30.36 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7611  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.63 
 
 
671 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.43 
 
 
581 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.61 
 
 
580 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.67 
 
 
714 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4149  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36 
 
 
680 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.498458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  28.25 
 
 
1502 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3402  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.76 
 
 
736 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7376  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.68 
 
 
736 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>