222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00942 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1092  nicotinate phosphoribosyltransferase  99.5 
 
 
400 aa  827    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000112466  normal  0.614516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00935  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
400 aa  831    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00018823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2712  nicotinate phosphoribosyltransferase  99.75 
 
 
400 aa  830    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1041  nicotinate phosphoribosyltransferase  91 
 
 
400 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1106  nicotinate phosphoribosyltransferase  91 
 
 
400 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.634691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00942  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  831    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000138975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
400 aa  831    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00456308  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1014  nicotinate phosphoribosyltransferase  90.75 
 
 
400 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1118  nicotinate phosphoribosyltransferase  91.25 
 
 
400 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0150287  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1073  nicotinate phosphoribosyltransferase  91 
 
 
400 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1039  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
400 aa  831    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00414982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2189  nicotinate phosphoribosyltransferase  99.25 
 
 
400 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.084522  normal  0.514532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2665  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
416 aa  830    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296295  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2387  nicotinate phosphoribosyltransferase  99.75 
 
 
400 aa  830    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0828745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1450  nicotinate phosphoribosyltransferase  88.25 
 
 
400 aa  747    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1786  nicotinate phosphoribosyltransferase  74.56 
 
 
401 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00758127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1668  nicotinate phosphoribosyltransferase  74.06 
 
 
401 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000219699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1732  nicotinate phosphoribosyltransferase  74.31 
 
 
401 aa  621  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128231  normal  0.731039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1639  nicotinate phosphoribosyltransferase  74.31 
 
 
401 aa  621  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0109745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2058  nicotinate phosphoribosyltransferase  73.57 
 
 
401 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1981  nicotinate phosphoribosyltransferase  73.07 
 
 
416 aa  611  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000489265  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2647  nicotinate phosphoribosyltransferase  73.32 
 
 
406 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0524303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2557  nicotinate phosphoribosyltransferase  73.32 
 
 
401 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000810876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1411  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.13 
 
 
399 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.997998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64960  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.93 
 
 
399 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.500667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5645  nicotinate phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
399 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2245  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.93 
 
 
399 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4945  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
398 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0548  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
407 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220672  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56900  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
398 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0595  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4921  nicotinate phosphoribosyltransferase  50.38 
 
 
407 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4868  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
402 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4660  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 
401 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4924  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
401 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.588245  hitchhiker  0.000000000198844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4746  nicotinate phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
401 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2449  nicotinate phosphoribosyltransferase  45.38 
 
 
399 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000692172  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1293  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3080  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1089  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.36 
 
 
416 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0167  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
406 aa  333  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2284  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
392 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887476  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0581  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
407 aa  332  6e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4740  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
406 aa  332  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35755  normal  0.607195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2932  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
398 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000292258  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
412 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000386017  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1620  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
399 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2067  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
406 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398487  hitchhiker  0.00430299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1697  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
399 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3306  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.43 
 
 
402 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0926787  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0510  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2501  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2812  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000325875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2873  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0365801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1772  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 
406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2931  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000120174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000451173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2781  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2203  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000037467  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1824  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00156311  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0980  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000687395  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0621  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000681686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1100  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000027143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1059  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000644735  normal  0.317841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4213  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 
399 aa  325  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000018976  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0808  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 
399 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000395003  normal  0.217385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1031  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
404 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120152  normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1368  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
398 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00031505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2492  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
398 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398443  normal  0.0193027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0559  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.47 
 
 
393 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618565  normal  0.0393004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6283  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000174127  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0041  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0976  nicotinate phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3719  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.91 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00517667  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5606  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.77 
 
 
399 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.643272 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1944  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06575  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000697  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
436 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0896  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 
389 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477693  normal  0.0227421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0961  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
389 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0442  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.22 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0385  nicotinate phosphoribosyltransferase  43.22 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1730  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
406 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404013  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0388  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.37 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0321  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
405 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3022  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.6 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00216966  normal  0.447003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0941  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
390 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2095  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0425605 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0338  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
390 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2472  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.7 
 
 
391 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0057  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
394 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87669  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
425 aa  209  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0250  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
434 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4452  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3345  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 
430 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4138  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.96 
 
 
434 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775581  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2365  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.42 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229166  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0200  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
434 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0025  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
430 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4562  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.92 
 
 
432 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021535  normal  0.183994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>