39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00389 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3175  Uncharacterized lipoprotein  99.48 
 
 
192 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000125975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00389  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0518  hypothetical protein  98.96 
 
 
192 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497712  normal  0.496447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0356  hypothetical protein  98.44 
 
 
192 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000341727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0475  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000010636  normal  0.521342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3199  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000111973  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0469  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0509  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.43664e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00385  predicted lipoprotein  100 
 
 
192 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0901  hypothetical protein  88.54 
 
 
192 aa  352  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00248471  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3057  hypothetical protein  71.88 
 
 
192 aa  297  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000433133  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3238  hypothetical protein  71.88 
 
 
192 aa  297  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.317659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3095  hypothetical protein  71.88 
 
 
192 aa  297  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000982168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1045  hypothetical protein  68.23 
 
 
192 aa  287  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3267  hypothetical protein  67.19 
 
 
192 aa  284  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.341142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2880  hypothetical protein  67.71 
 
 
192 aa  278  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.251082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3071  hypothetical protein  66.67 
 
 
192 aa  277  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1092  hypothetical protein  72.78 
 
 
192 aa  261  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0774  putative lipoprotein  30.05 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1081  hypothetical protein  26.56 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000167601  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002704  putative lipoprotein  26.86 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03278  hypothetical protein  25.71 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3439  uncharacterized lipoprotein  25.65 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2889  uncharacterized lipoprotein  28.27 
 
 
188 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3110  hypothetical protein  23.83 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3641  hypothetical protein  26.32 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.689119  normal  0.360346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3720  hypothetical protein  24.16 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3528  lipoprotein  24.16 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000697535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3111  putative lipoprotein  22.75 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3597  hypothetical protein  24.16 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0714  hypothetical protein  24.16 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0786  hypothetical protein  23.16 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0815  hypothetical protein  23.16 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3811  putative lipoprotein  22.29 
 
 
188 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3152  hypothetical protein  23.16 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0710  putative lipoprotein  24.18 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0822  hypothetical protein  23.86 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1887  putative lipoprotein  22.51 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.998777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2553  putative lipoprotein  21.83 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>