16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00041 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00042    100 
 
 
1217 bp  2413    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3561  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  99.34 
 
 
1218 bp  2343    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0042  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  98.03 
 
 
1218 bp  2216    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0040  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  98.52 
 
 
1218 bp  2264    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3617  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  99.34 
 
 
1218 bp  2343    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0704222 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0039  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  97.7 
 
 
1218 bp  2185    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0076  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  84.94 
 
 
1272 bp  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.525177  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0076  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  84.35 
 
 
1272 bp  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0080  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  84.77 
 
 
1272 bp  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.699526  normal  0.669328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0079  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  84.94 
 
 
1221 bp  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0078  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  84.43 
 
 
1272 bp  866    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137768  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0042  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  98.36 
 
 
1218 bp  2248    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00041    100 
 
 
1217 bp  2413    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2674  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  84.15 
 
 
1227 bp  377  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3227  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  83.1 
 
 
1227 bp  315  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4036  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  80.19 
 
 
1263 bp  212  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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