More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52480 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  97.73 
 
 		 44 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  95.45 
 
 		 44 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  93.18 
 
 		 44 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  93.18 
 
 		 44 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  90.91 
 
 		 44 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  90.91 
 
 		 44 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  90.91 
 
 		 44 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 46 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 44 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 44 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 44 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 44 aa  74.7  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 44 aa  74.7  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 44 aa  74.7  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 		 44 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  83.72 
 
 		 44 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 		 44 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 		 44 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  83.33 
 
 		 45 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 		 44 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  79.07 
 
 		 44 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  79.07 
 
 		 44 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  81.4 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 47 aa  67.4  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  81.4 
 
 		 46 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  75 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  77.27 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 52 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 48 aa  65.5  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 52 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 52 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 46 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  78.57 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  72.73 
 
 		 52 aa  64.3  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 52 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  75 
 
 		 53 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03586  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4263  ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0238859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4154  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.84291e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 50 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4178  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000372649  normal  0.0228547 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4213  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000247628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4292  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00044524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4052  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00017191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4249  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000856775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4231  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00039981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4124  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00205237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4222  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000812613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4152  50S ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000170449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4267  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000537896  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4067  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000113234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4070  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00184884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4174  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.806071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03530  hypothetical protein  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0943664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3916  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000106535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5133  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000882386  normal  0.0201303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 51 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 52 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4295  ribosomal protein L34  86.36 
 
 		 46 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00232531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 45 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>