92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  100 
 
 
357 aa  741    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  68.22 
 
 
361 aa  474  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  61.41 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  60.56 
 
 
353 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  61.25 
 
 
351 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  60.17 
 
 
352 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  60.17 
 
 
352 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  60.81 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  60.81 
 
 
355 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  56.9 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  56.43 
 
 
340 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  52.26 
 
 
356 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  53.22 
 
 
343 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  50.86 
 
 
344 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  53.15 
 
 
342 aa  359  4e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  51.7 
 
 
350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  54.07 
 
 
334 aa  346  4e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  53.35 
 
 
340 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  52 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  48.74 
 
 
342 aa  310  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  47.46 
 
 
342 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  45.59 
 
 
344 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  48.3 
 
 
342 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  45.16 
 
 
353 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  44.17 
 
 
366 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  43.81 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  46.01 
 
 
352 aa  282  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  44.89 
 
 
333 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  46.62 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  41.35 
 
 
345 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  46.13 
 
 
338 aa  272  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  41.46 
 
 
344 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  44.05 
 
 
342 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  41.94 
 
 
341 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  44.55 
 
 
343 aa  262  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  40.73 
 
 
332 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  43.05 
 
 
334 aa  261  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  40.91 
 
 
359 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  42.81 
 
 
337 aa  258  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  40.75 
 
 
341 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  41.09 
 
 
344 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  39.94 
 
 
354 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  40.48 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  40.48 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  41.8 
 
 
342 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  39.24 
 
 
369 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.9 
 
 
336 aa  245  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  42.91 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  43.1 
 
 
352 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  43.22 
 
 
335 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  41.91 
 
 
339 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  39.81 
 
 
356 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  43.18 
 
 
281 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  42.51 
 
 
333 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  39.23 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  39.86 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  41.43 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  40.57 
 
 
242 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  31.5 
 
 
344 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  37.61 
 
 
197 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  37.61 
 
 
328 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  61.04 
 
 
105 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  41.48 
 
 
144 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  38.14 
 
 
333 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  34.97 
 
 
192 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  37.12 
 
 
334 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  37.19 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  33.9 
 
 
324 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  33.9 
 
 
324 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  39.09 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  42.73 
 
 
154 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  36.51 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  37.27 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  37.86 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  34.4 
 
 
141 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  33.6 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  29.66 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  34.51 
 
 
127 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  29.91 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  33.05 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  30.71 
 
 
198 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  33.04 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  45.33 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  33.02 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  33.02 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  45.24 
 
 
117 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  43.42 
 
 
90 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  25.64 
 
 
327 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  27.71 
 
 
108 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  21.6 
 
 
135 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  33.8 
 
 
81 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  25.56 
 
 
121 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>