More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  53.12 
 
 
696 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  55.95 
 
 
703 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  56.29 
 
 
703 aa  790    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  54.75 
 
 
692 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  57.12 
 
 
701 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  53.12 
 
 
696 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
709 aa  1419    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  63.31 
 
 
708 aa  897    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  61.65 
 
 
703 aa  872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  44.93 
 
 
708 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  44.63 
 
 
734 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 
711 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  43.36 
 
 
710 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  45.88 
 
 
710 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  42.71 
 
 
711 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  42.57 
 
 
708 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  43.48 
 
 
736 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  43.05 
 
 
709 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  43.58 
 
 
714 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  43.43 
 
 
732 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  41.71 
 
 
741 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  42.28 
 
 
738 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  41.4 
 
 
689 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  42.02 
 
 
722 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 
689 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  41.27 
 
 
730 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  40.99 
 
 
757 aa  482  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  39.11 
 
 
689 aa  475  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  38.65 
 
 
722 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 
715 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 
701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  39.61 
 
 
703 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  39.72 
 
 
701 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  37.8 
 
 
712 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  39.01 
 
 
701 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  39.15 
 
 
701 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 
722 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  38.72 
 
 
701 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  38.72 
 
 
701 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 
701 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  37.97 
 
 
710 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 
724 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 
724 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 
723 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 
720 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 
720 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 
702 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 
702 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 
715 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
720 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
720 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 
707 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
720 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 
714 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.52 
 
 
713 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 
860 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  34.12 
 
 
699 aa  353  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 
837 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 
726 aa  340  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 
817 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 
726 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  35.56 
 
 
850 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 
864 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 
862 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 
720 aa  327  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.59 
 
 
799 aa  326  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
743 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 
825 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 
825 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  32.4 
 
 
815 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 
843 aa  310  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  36.81 
 
 
795 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  36.57 
 
 
795 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  32.3 
 
 
821 aa  297  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 
859 aa  293  9e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
726 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.11 
 
 
706 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 
705 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 
792 aa  291  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
689 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
689 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 
796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 
796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 
719 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 
796 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 
713 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 
819 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 
796 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 
721 aa  280  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
829 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.01 
 
 
698 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.18 
 
 
733 aa  276  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 
700 aa  275  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  30.68 
 
 
713 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 
707 aa  274  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.84 
 
 
833 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.13 
 
 
829 aa  273  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  30.68 
 
 
713 aa  273  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 
730 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 
809 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>