230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
446 aa  878    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  65.98 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  56.95 
 
 
456 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  57.18 
 
 
449 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3160  Na+/H+ antiporter NhaA  58.28 
 
 
326 aa  348  1e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  42.47 
 
 
468 aa  322  9.000000000000001e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  43.33 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  42.86 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  41.92 
 
 
452 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  44.12 
 
 
445 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  41.31 
 
 
451 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.91 
 
 
455 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  42.28 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  41.71 
 
 
457 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  38.55 
 
 
455 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  41.28 
 
 
455 aa  276  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  38.29 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  42.33 
 
 
436 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  42.33 
 
 
451 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  38.3 
 
 
450 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  40.23 
 
 
472 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  41.43 
 
 
423 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  44.5 
 
 
481 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  40.85 
 
 
465 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  35.78 
 
 
464 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  42.05 
 
 
426 aa  263  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  39.44 
 
 
438 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  35.62 
 
 
438 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.21 
 
 
430 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  40.19 
 
 
424 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  34.4 
 
 
444 aa  256  5e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.97 
 
 
388 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  34.72 
 
 
427 aa  256  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.06 
 
 
876 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.48 
 
 
388 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  37.41 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  37.59 
 
 
402 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.94 
 
 
391 aa  249  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  41.48 
 
 
388 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.68 
 
 
390 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  35.44 
 
 
475 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  34.43 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.56 
 
 
395 aa  242  7.999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  37.08 
 
 
629 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  33.19 
 
 
450 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.79 
 
 
421 aa  240  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  34.61 
 
 
386 aa  239  9e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  39.41 
 
 
460 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  35 
 
 
394 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.02 
 
 
391 aa  239  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.64 
 
 
394 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  34.43 
 
 
395 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.64 
 
 
394 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.66 
 
 
389 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.83 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.19 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.56 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  34.89 
 
 
406 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.11 
 
 
392 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  34.58 
 
 
391 aa  232  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  34.1 
 
 
424 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  37.38 
 
 
616 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  34.48 
 
 
398 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  36.82 
 
 
514 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.9 
 
 
397 aa  229  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  37.2 
 
 
425 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.48 
 
 
398 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  33.93 
 
 
475 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.79 
 
 
391 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  38.72 
 
 
404 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.13 
 
 
391 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.31 
 
 
401 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.89 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.49 
 
 
389 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.96 
 
 
389 aa  226  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.49 
 
 
389 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.49 
 
 
389 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.49 
 
 
389 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.49 
 
 
391 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.82 
 
 
397 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  37.28 
 
 
393 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.19 
 
 
389 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  36.72 
 
 
617 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 
472 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.19 
 
 
389 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  34.23 
 
 
389 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.59 
 
 
397 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.25 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  34.52 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>