154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  658    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  67.54 
 
 
341 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  71.76 
 
 
338 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  72.06 
 
 
338 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  36.39 
 
 
354 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.79 
 
 
356 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  33 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  31.85 
 
 
356 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  31.85 
 
 
356 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  31.55 
 
 
356 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5983  type VI secretion protein  34.66 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  34.86 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  32.14 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.97 
 
 
343 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.45 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  33.84 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  31.49 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  31.67 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.82 
 
 
344 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  29.57 
 
 
328 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  31.61 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  29.31 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.86 
 
 
388 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  30.12 
 
 
354 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.76 
 
 
359 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  30.58 
 
 
367 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  29.19 
 
 
328 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  28.72 
 
 
366 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.26 
 
 
364 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.91 
 
 
362 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  29.82 
 
 
366 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  28.49 
 
 
357 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.62 
 
 
349 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.67 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.25 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.53 
 
 
332 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.53 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  27.61 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.05 
 
 
366 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  28.61 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  29.91 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  28.41 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  27.72 
 
 
357 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  29.22 
 
 
361 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  27.76 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  27.76 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.48 
 
 
337 aa  96.3  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  29.81 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  28.05 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  30.5 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  30.5 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  30.5 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.25 
 
 
385 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  30.95 
 
 
338 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.54 
 
 
349 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  30.19 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  30.19 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  30.19 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  27.73 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  25.99 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.07 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  28.03 
 
 
352 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.07 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.07 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  28.31 
 
 
338 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  29.18 
 
 
338 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  29.73 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  28.31 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  28.52 
 
 
427 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.81 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  30.95 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  30.79 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  28.68 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  27.41 
 
 
321 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  28.49 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  29.35 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  27.62 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  30.25 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  28.51 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  31.82 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  30.25 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  30.25 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  29.07 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  27.36 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  28.51 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.18 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.18 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  29.02 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  29.22 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  26.79 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  30.81 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  25.33 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>