56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  56.67 
 
 
254 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  58.96 
 
 
252 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  59.18 
 
 
252 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  30.13 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  33.58 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  35.51 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  37.8 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  37.8 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  37.8 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  34.18 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  34 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  32.2 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  34.07 
 
 
218 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.62 
 
 
260 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  38.36 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  35.56 
 
 
262 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  38.36 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  38.36 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  32.2 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  35.62 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  30.05 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  30.05 
 
 
228 aa  48.9  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  25.32 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  26.62 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  28.24 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  32.93 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  32.93 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  30.05 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  31 
 
 
460 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  34.41 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  30.05 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  29.3 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  29.17 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 
463 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.89 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.89 
 
 
258 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  36.17 
 
 
215 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  30.26 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.57 
 
 
442 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31.91 
 
 
469 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.58 
 
 
258 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  27.66 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  27.85 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  32.8 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  27.85 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  24.29 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  28.71 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  33.73 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  29.77 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
429 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  30.85 
 
 
430 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  31.03 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  24.29 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  32.97 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  24.86 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>