72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  100 
 
 
246 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  70.73 
 
 
244 aa  314  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  47.86 
 
 
252 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  44.68 
 
 
245 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  44.68 
 
 
245 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  44.26 
 
 
245 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  44.68 
 
 
245 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  42.61 
 
 
249 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  45.11 
 
 
245 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  44.86 
 
 
245 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  45.11 
 
 
245 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  46.15 
 
 
252 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  47.9 
 
 
255 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  45 
 
 
257 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  43.28 
 
 
251 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  44.77 
 
 
251 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  45.38 
 
 
252 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  44.58 
 
 
255 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  44.98 
 
 
276 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  45.38 
 
 
254 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  42.11 
 
 
255 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  39.42 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  41.39 
 
 
254 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  42.98 
 
 
247 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  40.49 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  42.02 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  40.98 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  41.18 
 
 
245 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  42.02 
 
 
245 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  41.84 
 
 
256 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  39.67 
 
 
250 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  40.76 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  38.82 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  38.5 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  38.5 
 
 
253 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  36.93 
 
 
282 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  39.29 
 
 
250 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  33.61 
 
 
260 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  33.61 
 
 
260 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  33.61 
 
 
260 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  44.25 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  36.46 
 
 
252 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
259 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  33.49 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  29.91 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  30.74 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  27.65 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  26.11 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  25.37 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.32 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  30.93 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.11 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.83 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.39 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.51 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  29.51 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  36.63 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  29.35 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  29.92 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  30.1 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  29.59 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.61 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  25.43 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  30.59 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>