47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  100 
 
 
979 aa  1983    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  92.44 
 
 
1045 aa  1841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  69.33 
 
 
462 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  53.54 
 
 
694 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  60.05 
 
 
406 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  25.6 
 
 
1143 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  25.07 
 
 
1126 aa  212  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  25.18 
 
 
1125 aa  212  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  22.9 
 
 
1137 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  24.57 
 
 
1124 aa  207  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  26.01 
 
 
1122 aa  205  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  26.47 
 
 
1121 aa  187  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  24.09 
 
 
1128 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  25.13 
 
 
1118 aa  186  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.71 
 
 
1121 aa  184  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.65 
 
 
1121 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  26.68 
 
 
1125 aa  180  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  26.11 
 
 
1133 aa  177  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  25.35 
 
 
1121 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  24.87 
 
 
1124 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  24.27 
 
 
1121 aa  170  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.52 
 
 
1144 aa  168  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.82 
 
 
1143 aa  167  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  23.87 
 
 
1123 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  23.74 
 
 
1130 aa  164  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.54 
 
 
1140 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  24.49 
 
 
1153 aa  160  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  24.08 
 
 
1136 aa  154  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  23.94 
 
 
1126 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  23.76 
 
 
1121 aa  152  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  23.51 
 
 
1120 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  23.51 
 
 
1120 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  23.5 
 
 
1118 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  23.84 
 
 
1120 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  23.25 
 
 
1154 aa  145  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.29 
 
 
1120 aa  142  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  22.81 
 
 
1133 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  22.47 
 
 
1120 aa  140  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  23.55 
 
 
1125 aa  134  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  22.15 
 
 
1114 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  23.46 
 
 
1151 aa  123  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  22.17 
 
 
1146 aa  90.5  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  24.56 
 
 
1166 aa  87  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  30.24 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  20.94 
 
 
1181 aa  81.6  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  28.31 
 
 
1140 aa  49.7  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  27.88 
 
 
1141 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>