77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  57.14 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  61.54 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  63.49 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  52.11 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  55.56 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  54.41 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  39.13 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  37.68 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1539  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0419417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4838  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3037  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5453  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2963  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.364459  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  33.33 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  33.33 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  35.48 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  35.48 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1666  aspartate/glutamate/uridylate kinase-like protein  31.15 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.962131  hitchhiker  0.00000000000435388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2649  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1496  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000868778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 71 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4401  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5459  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0131549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0305  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00365078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  32.2 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3131  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 77 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4237  putative transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  30.65 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2806  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  26.67 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5711  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3008  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2481  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.400931  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2733  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5346  putative transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2853  putative transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 86 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>