More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  100 
 
 		 325 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  78.64 
 
 		 325 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  66.77 
 
 		 325 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  65.03 
 
 		 326 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  64.72 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  64.31 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  63.69 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  65.03 
 
 		 326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  66.15 
 
 		 326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  64.42 
 
 		 326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  69.41 
 
 		 327 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  68.21 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  56.7 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  56.57 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  55.05 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  55.05 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  54.74 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  54.74 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  54.74 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  54.18 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  53.97 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  55.3 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  51.16 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  50.5 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  48.59 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  45.51 
 
 		 329 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  43.56 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  41.1 
 
 		 325 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  49.84 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  44.65 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  43.94 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  36.6 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  35.22 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  37.24 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  34.67 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  30.37 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  33.55 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  31.77 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  28.48 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  28.53 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  29.18 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  29.3 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  28.7 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  29.29 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  28.19 
 
 		 346 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  29.3 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.61 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  28.28 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.25 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.25 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  29.65 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  29.87 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.27 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  24.62 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  28.39 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  32.09 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  24.77 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  30.69 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.36 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  31.18 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  28.34 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  28.38 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  27.07 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  29.19 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  27.19 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  25.68 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  26.65 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  30.23 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  27.13 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  28 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  26.3 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  26.22 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  31.5 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  26.81 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  27.21 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  25.42 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  28.76 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  32.5 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  26.51 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  26.51 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  30.53 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  26.47 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  26.47 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  26.47 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  26.9 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  26.54 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  25.46 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  31.44 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  29.62 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  26.17 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  24.68 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  25.26 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  24.04 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  28.05 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  28.45 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  23.53 
 
 		 345 aa  99  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  26.87 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  28.34 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>