More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  100 
 
 
474 aa  927    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.18 
 
 
463 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.4 
 
 
459 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.96 
 
 
459 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.31 
 
 
459 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  71.3 
 
 
461 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  71.43 
 
 
460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  67.54 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  67.76 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.23 
 
 
465 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  71.76 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  41.77 
 
 
466 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  43.98 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  40.68 
 
 
475 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
472 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  39.09 
 
 
489 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  40.09 
 
 
474 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
474 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
474 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.51 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  40.69 
 
 
496 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
476 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2927  tricarboxylic transport: regulatory protein  38.32 
 
 
471 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2963  tricarboxylic transport: regulatory protein  38.32 
 
 
471 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2980  tricarboxylic transport regulatory protein  38.32 
 
 
471 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.675571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2896  tricarboxylic transport: regulatory protein  38.32 
 
 
471 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  40.19 
 
 
504 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3083  tricarboxylic transporter regulatory protein  38.32 
 
 
471 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  40.52 
 
 
473 aa  259  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
485 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  39.86 
 
 
501 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  39.86 
 
 
501 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  39.91 
 
 
472 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  39.86 
 
 
501 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  39.86 
 
 
501 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  39.86 
 
 
501 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
501 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.58 
 
 
513 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  36.52 
 
 
499 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
479 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.33 
 
 
526 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  39.69 
 
 
471 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
524 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
531 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  38.66 
 
 
439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.86 
 
 
463 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.18 
 
 
500 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
462 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  37.02 
 
 
508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
464 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  36.21 
 
 
495 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  36.55 
 
 
460 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
515 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35 
 
 
501 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
462 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  34.87 
 
 
517 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  37.08 
 
 
466 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
465 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
519 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
517 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
517 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
517 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.32 
 
 
518 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
515 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.32 
 
 
523 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  38.17 
 
 
467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.32 
 
 
817 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.18 
 
 
517 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  36.07 
 
 
460 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  35.48 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.67 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.68 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.88 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  36.59 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  36.53 
 
 
464 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
457 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  35.55 
 
 
495 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
469 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.92 
 
 
505 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  36.93 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  35.12 
 
 
506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4162  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.37 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.37 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.37 
 
 
505 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
481 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>